62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1706 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1706  hypothetical protein  100 
 
 		 507 aa  1027    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.936741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0344  protein of unknown function DUF88  54.37 
 
 		 504 aa  528  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.752457  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0028  protein of unknown function DUF88  53.69 
 
 		 509 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0056  protein of unknown function DUF88  51.12 
 
 		 448 aa  462  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3848  hypothetical protein  49.6 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4578  protein of unknown function DUF88  35.48 
 
 		 527 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.975373  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2484  hypothetical protein  40 
 
 		 439 aa  199  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00113577  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1187  hypothetical protein  39.71 
 
 		 418 aa  195  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000236385  decreased coverage  0.000174597 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3051  protein of unknown function DUF88  39.48 
 
 		 418 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10856 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0587  protein of unknown function DUF88  47 
 
 		 240 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000787089  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1289  protein of unknown function DUF88  50.91 
 
 		 474 aa  178  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  hitchhiker  0.00441203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3564  hypothetical protein  37.35 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0546  protein of unknown function DUF88  32 
 
 		 426 aa  141  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  27.98 
 
 		 275 aa  87.4  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  30.81 
 
 		 564 aa  84  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  30.06 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  29.41 
 
 		 507 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  30 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  30 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  30 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  29.41 
 
 		 501 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  29.29 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  30 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  30.37 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  27.23 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  29.41 
 
 		 508 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  28.72 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  27.5 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  27.5 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  28.82 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  28.82 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  30 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  28.49 
 
 		 264 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  27.23 
 
 		 249 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  29.24 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  29.24 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  29.24 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  29.37 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  26.55 
 
 		 260 aa  59.7  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  33.04 
 
 		 251 aa  56.2  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  26.53 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  27.97 
 
 		 470 aa  52  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  27.47 
 
 		 272 aa  50.1  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0304  hypothetical protein  27.66 
 
 		 215 aa  50.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1608  hypothetical protein  26.95 
 
 		 215 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.675202  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  22.67 
 
 		 787 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0373  hypothetical protein  24.32 
 
 		 215 aa  49.3  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  22.67 
 
 		 842 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  27.47 
 
 		 268 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  30.71 
 
 		 286 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  32.94 
 
 		 432 aa  45.4  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  37.97 
 
 		 276 aa  45.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  32.11 
 
 		 264 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  25.47 
 
 		 432 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0095  hypothetical protein  24.71 
 
 		 273 aa  44.3  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0117028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1404  protein of unknown function DUF88  24.22 
 
 		 296 aa  44.3  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.516072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  22.22 
 
 		 789 aa  44.3  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  29.41 
 
 		 239 aa  44.3  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  45.45 
 
 		 259 aa  43.9  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  46.67 
 
 		 284 aa  43.9  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0543  hypothetical protein  29.91 
 
 		 193 aa  43.9  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0180  hypothetical protein  27.27 
 
 		 254 aa  43.5  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>