24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2825 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2825  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2418  hypothetical protein  67.66 
 
 		 247 aa  329  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1693  hypothetical protein  60 
 
 		 236 aa  289  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0029  hypothetical protein  42.16 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22170  hypothetical protein  42.79 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0106  hypothetical protein  36.6 
 
 		 240 aa  138  7e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000384209  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1124  hypothetical protein  40.48 
 
 		 180 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.355557  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2212  hypothetical protein  34.84 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.526644  normal  0.367498 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0373  hypothetical protein  26.26 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1911  protein of unknown function DUF88  39.62 
 
 		 484 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2275  protein of unknown function DUF88  44.44 
 
 		 188 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0304  hypothetical protein  25.25 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1608  hypothetical protein  25.25 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.675202  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0543  hypothetical protein  25.25 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1465  hypothetical protein  38.78 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4132  protein of unknown function DUF88  32.47 
 
 		 333 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0698  hypothetical protein  34.09 
 
 		 304 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0221  hypothetical protein  22.86 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0543  hypothetical protein  38.78 
 
 		 180 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0589546  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1318  hypothetical protein  32.95 
 
 		 313 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0443  hypothetical protein  42 
 
 		 216 aa  42  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220081  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_287  hypothetical protein  40.91 
 
 		 194 aa  42  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000717319  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  40.91 
 
 		 194 aa  42  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  40.91 
 
 		 194 aa  42  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>