21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1911 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1911  protein of unknown function DUF88  100 
 
 
484 aa  926    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3359  hypothetical protein  44.51 
 
 
404 aa  161  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1151  hypothetical protein  48.3 
 
 
388 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.111113  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5741  protein of unknown function DUF88  45.89 
 
 
435 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0698  hypothetical protein  39.87 
 
 
304 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1318  hypothetical protein  39.47 
 
 
313 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4132  protein of unknown function DUF88  43.51 
 
 
333 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0396  hypothetical protein  37.95 
 
 
393 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0791  hypothetical protein  41.45 
 
 
335 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13215  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0226  protein of unknown function DUF88  40.3 
 
 
446 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0183  hypothetical protein  32.54 
 
 
468 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4611  protein of unknown function DUF88  33.73 
 
 
574 aa  90.5  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0253473  normal  0.838732 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  31.07 
 
 
181 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  26.74 
 
 
194 aa  60.1  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.6 
 
 
1888 aa  58.2  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2603  hypothetical protein  28 
 
 
277 aa  53.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  36.21 
 
 
671 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  37.5 
 
 
830 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1748  hypothetical protein  29.07 
 
 
284 aa  48.5  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32.95 
 
 
2313 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  39 
 
 
551 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>