24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1151 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1151  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  784    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.111113  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3359  hypothetical protein  40.19 
 
 
404 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1911  protein of unknown function DUF88  48.3 
 
 
484 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0698  hypothetical protein  38.33 
 
 
304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1318  hypothetical protein  36.46 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0396  hypothetical protein  40.85 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0183  hypothetical protein  33.02 
 
 
468 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0791  hypothetical protein  35.71 
 
 
335 aa  109  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13215  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4132  protein of unknown function DUF88  38.1 
 
 
333 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0226  protein of unknown function DUF88  39.55 
 
 
446 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3005  hypothetical protein  38.03 
 
 
516 aa  100  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5741  protein of unknown function DUF88  32.54 
 
 
435 aa  99.4  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4611  protein of unknown function DUF88  38.81 
 
 
574 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0253473  normal  0.838732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2603  hypothetical protein  33.67 
 
 
277 aa  60.8  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  31.94 
 
 
181 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1748  hypothetical protein  26.47 
 
 
284 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2275  protein of unknown function DUF88  28.93 
 
 
188 aa  49.7  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1300  protein of unknown function DUF88  34.29 
 
 
208 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000638541  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1465  hypothetical protein  30.13 
 
 
188 aa  48.5  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  31.25 
 
 
195 aa  45.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  28.46 
 
 
305 aa  44.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5380  protein of unknown function DUF88  28.16 
 
 
356 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.458157 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2212  hypothetical protein  25.44 
 
 
201 aa  43.1  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.526644  normal  0.367498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>