28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5741 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5741  protein of unknown function DUF88  100 
 
 		 435 aa  869    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4132  protein of unknown function DUF88  45.76 
 
 		 333 aa  137  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0791  hypothetical protein  42.94 
 
 		 335 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0698  hypothetical protein  43.5 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1318  hypothetical protein  43.18 
 
 		 313 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0396  hypothetical protein  40.58 
 
 		 393 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0226  protein of unknown function DUF88  40.1 
 
 		 446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0183  hypothetical protein  38.71 
 
 		 468 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0923837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3005  hypothetical protein  38.67 
 
 		 516 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1911  protein of unknown function DUF88  45.89 
 
 		 484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4611  protein of unknown function DUF88  37.99 
 
 		 574 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0253473  normal  0.838732 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1151  hypothetical protein  32.54 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.111113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3359  hypothetical protein  36.55 
 
 		 404 aa  94.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2603  hypothetical protein  35.29 
 
 		 277 aa  87  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  30.16 
 
 		 195 aa  62.4  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1748  hypothetical protein  32.61 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  31.54 
 
 		 181 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2275  protein of unknown function DUF88  23.56 
 
 		 188 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5380  protein of unknown function DUF88  29.27 
 
 		 356 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.458157 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1465  hypothetical protein  23.12 
 
 		 188 aa  51.6  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3991  protein of unknown function DUF88  27.81 
 
 		 226 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4033  protein of unknown function DUF88  27.81 
 
 		 226 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.424874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3333  protein of unknown function DUF88  27.54 
 
 		 207 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.258648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1143  hypothetical protein  28.14 
 
 		 198 aa  45.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4859  hypothetical protein  28.14 
 
 		 210 aa  44.3  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0181079  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  26.43 
 
 		 194 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2722  hypothetical protein  28.14 
 
 		 209 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353362  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  26.11 
 
 		 305 aa  43.1  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>