25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1465 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1465  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  390  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2275  protein of unknown function DUF88  34.02 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  26.4 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1911  protein of unknown function DUF88  28.47 
 
 		 484 aa  54.7  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5741  protein of unknown function DUF88  23.12 
 
 		 435 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2212  hypothetical protein  34.57 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.526644  normal  0.367498 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1151  hypothetical protein  30.13 
 
 		 388 aa  48.5  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.111113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  24.5 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0029  hypothetical protein  45.1 
 
 		 271 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2418  hypothetical protein  26.95 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0526  hypothetical protein  35.21 
 
 		 295 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_287  hypothetical protein  24.5 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000717319  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22170  hypothetical protein  43.66 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1124  hypothetical protein  32.17 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.355557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1318  hypothetical protein  25.56 
 
 		 313 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2825  hypothetical protein  38.78 
 
 		 244 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  23.84 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0543  hypothetical protein  28.21 
 
 		 180 aa  45.1  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0589546  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4264  protein of unknown function DUF88  22.99 
 
 		 261 aa  45.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.110451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1693  hypothetical protein  40.82 
 
 		 236 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0106  hypothetical protein  41.51 
 
 		 240 aa  42.7  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000384209  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5380  protein of unknown function DUF88  30.28 
 
 		 356 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.458157 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  25.5 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3359  hypothetical protein  39.39 
 
 		 404 aa  41.6  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4132  protein of unknown function DUF88  25.4 
 
 		 333 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>