23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3359 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3359  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  801    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1151  hypothetical protein  42.68 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.111113  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1911  protein of unknown function DUF88  44.51 
 
 
484 aa  156  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4132  protein of unknown function DUF88  35.53 
 
 
333 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0396  hypothetical protein  28.54 
 
 
393 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1318  hypothetical protein  38.96 
 
 
313 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0698  hypothetical protein  37.22 
 
 
304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0226  protein of unknown function DUF88  41.04 
 
 
446 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3005  hypothetical protein  31.35 
 
 
516 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0183  hypothetical protein  37.32 
 
 
468 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0791  hypothetical protein  35.44 
 
 
335 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13215  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5741  protein of unknown function DUF88  36.55 
 
 
435 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4611  protein of unknown function DUF88  32.73 
 
 
574 aa  86.3  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0253473  normal  0.838732 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  38.1 
 
 
181 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2603  hypothetical protein  25.93 
 
 
277 aa  60.5  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1748  hypothetical protein  28.68 
 
 
284 aa  54.7  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  29.73 
 
 
194 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_287  hypothetical protein  29.25 
 
 
194 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000717319  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  30.72 
 
 
195 aa  50.8  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2275  protein of unknown function DUF88  31.21 
 
 
188 aa  49.7  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0543  hypothetical protein  26.6 
 
 
180 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0589546  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1893  hypothetical protein  25.42 
 
 
213 aa  43.1  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  hitchhiker  0.00176101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>