21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0183 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0183  hypothetical protein  100 
 
 
468 aa  916    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0396  hypothetical protein  76.24 
 
 
393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0226  protein of unknown function DUF88  66.67 
 
 
446 aa  273  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4611  protein of unknown function DUF88  62.38 
 
 
574 aa  259  9e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0253473  normal  0.838732 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3005  hypothetical protein  70.65 
 
 
516 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5741  protein of unknown function DUF88  38.22 
 
 
435 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1151  hypothetical protein  39.73 
 
 
388 aa  111  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.111113  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0698  hypothetical protein  36.87 
 
 
304 aa  103  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3359  hypothetical protein  37.32 
 
 
404 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4132  protein of unknown function DUF88  36.84 
 
 
333 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1911  protein of unknown function DUF88  32.02 
 
 
484 aa  98.2  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1318  hypothetical protein  32.18 
 
 
313 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0791  hypothetical protein  34.29 
 
 
335 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13215  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2603  hypothetical protein  34.9 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  31.74 
 
 
2914 aa  65.5  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  24.62 
 
 
2449 aa  57.8  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  25.58 
 
 
1888 aa  54.3  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  33.11 
 
 
181 aa  53.5  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1748  hypothetical protein  29.75 
 
 
284 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  24.71 
 
 
2313 aa  47  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00809  DNA-directed RNA polymerase Fragment (EC 2.7.7.6) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873Q6]  31.1 
 
 
1745 aa  43.1  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0591405  normal  0.0228147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>