172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2661 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  100 
 
 
181 aa  365  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  42.26 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  35.93 
 
 
194 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_287  hypothetical protein  37.13 
 
 
194 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000717319  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  35.93 
 
 
194 aa  100  8e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1143  hypothetical protein  36.2 
 
 
198 aa  91.7  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3333  protein of unknown function DUF88  34.36 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.258648  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0096  protein of unknown function DUF88  34.97 
 
 
201 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.263134 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0543  hypothetical protein  36.73 
 
 
180 aa  87.4  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0589546  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1943  hypothetical protein  32.53 
 
 
236 aa  87  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.423508  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4033  protein of unknown function DUF88  33.74 
 
 
226 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.424874  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3991  protein of unknown function DUF88  33.74 
 
 
226 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1805  hypothetical protein  32.3 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000048787 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4859  hypothetical protein  33.74 
 
 
210 aa  85.5  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0181079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2722  hypothetical protein  33.74 
 
 
209 aa  85.1  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353362  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2466  hypothetical protein  34.78 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1654  protein of unknown function DUF88  31.18 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0466931  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2805  hypothetical protein  34.88 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0945  hypothetical protein  32.58 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.279417 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  31.55 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2447  hypothetical protein  32.57 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1000  protein of unknown function DUF88  33.13 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1877  hypothetical protein  35.88 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000471771  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0671  hypothetical protein  32.54 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420654  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0649  hypothetical protein  30.85 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0944  hypothetical protein  33.72 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0294476  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2638  hypothetical protein  31.4 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1859  hypothetical protein  32.04 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00561567  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0991  protein of unknown function DUF88  31.4 
 
 
195 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  33.33 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1893  hypothetical protein  32.49 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  hitchhiker  0.00176101 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0165  protein of unknown function DUF88  28.48 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.334163 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3389  protein of unknown function DUF88  34.32 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1440  hypothetical protein  31.4 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3517  protein of unknown function DUF88  33.73 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0650346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3836  hypothetical protein  32.35 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3193  hypothetical protein  33.73 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.951691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  30.21 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  31.77 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  31.77 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  30.81 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2645  hypothetical protein  30 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  hitchhiker  0.00814137 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  32.93 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0758  hypothetical protein  30.25 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2865  hypothetical protein  31.36 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414585  normal  0.0571664 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3359  hypothetical protein  36.51 
 
 
404 aa  64.7  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4689  hypothetical protein  30.59 
 
 
217 aa  64.3  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501693  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1911  protein of unknown function DUF88  31.07 
 
 
484 aa  63.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2746  protein of unknown function DUF88  29.7 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0482662  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2606  hypothetical protein  30 
 
 
209 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0253982  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2633  hypothetical protein  30 
 
 
208 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0521932  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2966  protein of unknown function DUF88  30 
 
 
216 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180481  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1465  hypothetical protein  26.4 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2257  hypothetical protein  30 
 
 
206 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  33.73 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1924  hypothetical protein  29.76 
 
 
205 aa  62  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  32.54 
 
 
189 aa  62  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  28.57 
 
 
287 aa  61.6  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0482  hypothetical protein  27.92 
 
 
287 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2514  hypothetical protein  29.86 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0312456  normal  0.44225 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0528  hypothetical protein  32.61 
 
 
190 aa  60.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0275005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1723  hypothetical protein  30.86 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.761661  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1195  protein of unknown function DUF88  24.86 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1151  hypothetical protein  31.94 
 
 
388 aa  59.3  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.111113  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0379  protein of unknown function DUF88  28.72 
 
 
203 aa  59.3  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.31368  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0035  protein of unknown function DUF88  31.9 
 
 
219 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153842  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3179  protein of unknown function DUF88  28.22 
 
 
165 aa  57.8  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.488088  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0791  hypothetical protein  30.51 
 
 
335 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13215  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0796  protein of unknown function DUF88  29.45 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0033  hypothetical protein  30.67 
 
 
216 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0698  hypothetical protein  29.59 
 
 
304 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0226  protein of unknown function DUF88  34.48 
 
 
446 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0511  hypothetical protein  31.79 
 
 
191 aa  55.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0673  protein of unknown function DUF88  28.83 
 
 
165 aa  55.5  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.696503  normal  0.0525429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5741  protein of unknown function DUF88  31.54 
 
 
435 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0183  hypothetical protein  33.11 
 
 
468 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2781  hypothetical protein  29.19 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130399  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5380  protein of unknown function DUF88  28.12 
 
 
356 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.458157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0396  hypothetical protein  34.46 
 
 
393 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1407  hypothetical protein  27.61 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2943  hypothetical protein  28.09 
 
 
212 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1288  hypothetical protein  29.63 
 
 
157 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000264072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1318  hypothetical protein  32.88 
 
 
313 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0443  hypothetical protein  35.16 
 
 
216 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220081  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2568  hypothetical protein  33.59 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1578  hypothetical protein  28.14 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0544432  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4132  protein of unknown function DUF88  32.87 
 
 
333 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2873  protein of unknown function DUF88  31.06 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05689  hypothetical protein  27.78 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4611  protein of unknown function DUF88  34.25 
 
 
574 aa  52  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0253473  normal  0.838732 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2275  protein of unknown function DUF88  27.12 
 
 
188 aa  52  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2212  hypothetical protein  27.72 
 
 
201 aa  51.6  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.526644  normal  0.367498 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2008  protein of unknown function DUF88  25.31 
 
 
304 aa  50.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888225  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1124  hypothetical protein  31.03 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.355557  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00589  hypothetical protein  24.22 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8422  hypothetical protein  25.17 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3118  hypothetical protein  26.38 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.26612 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0893  hypothetical protein  26.09 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.38 
 
 
305 aa  48.9  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  29.61 
 
 
319 aa  48.5  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>