24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1318 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1318  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  626  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0698  hypothetical protein  81.21 
 
 
304 aa  489  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4132  protein of unknown function DUF88  65.95 
 
 
333 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0791  hypothetical protein  59.88 
 
 
335 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13215  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5741  protein of unknown function DUF88  43.18 
 
 
435 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3359  hypothetical protein  36.07 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1151  hypothetical protein  35.2 
 
 
388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.111113  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1911  protein of unknown function DUF88  39.47 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0183  hypothetical protein  32.98 
 
 
468 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3005  hypothetical protein  30.73 
 
 
516 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0226  protein of unknown function DUF88  35.63 
 
 
446 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2603  hypothetical protein  28.09 
 
 
277 aa  93.6  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0396  hypothetical protein  31.4 
 
 
393 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4611  protein of unknown function DUF88  35.82 
 
 
574 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0253473  normal  0.838732 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  30.54 
 
 
181 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0543  hypothetical protein  27.85 
 
 
180 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0589546  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  32.14 
 
 
194 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1748  hypothetical protein  32.09 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1124  hypothetical protein  35 
 
 
180 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.355557  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_287  hypothetical protein  32.11 
 
 
194 aa  46.2  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000717319  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1465  hypothetical protein  26.53 
 
 
188 aa  45.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  32.11 
 
 
194 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0443  hypothetical protein  29.41 
 
 
216 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2275  protein of unknown function DUF88  30.63 
 
 
188 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>