18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0443 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0443  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0543  hypothetical protein  28.9 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0589546  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  35.16 
 
 		 181 aa  52.8  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  36.36 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  35.23 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  43.86 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_287  hypothetical protein  38.81 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000717319  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2568  hypothetical protein  42.86 
 
 		 199 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0698  hypothetical protein  24.56 
 
 		 304 aa  45.4  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1318  hypothetical protein  29.41 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1693  hypothetical protein  41.07 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  26.23 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0029  hypothetical protein  41.18 
 
 		 271 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1300  protein of unknown function DUF88  28.4 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000638541  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0791  hypothetical protein  32.88 
 
 		 335 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  37.5 
 
 		 251 aa  42.4  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2825  hypothetical protein  42 
 
 		 244 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2418  hypothetical protein  40 
 
 		 247 aa  42  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0253809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>