95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0347 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  409  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_287  hypothetical protein  96.39 
 
 		 194 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000717319  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  94.85 
 
 		 194 aa  391  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  40.7 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  35.93 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0543  hypothetical protein  27.75 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0589546  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1654  protein of unknown function DUF88  27.27 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0466931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1805  hypothetical protein  28.88 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000048787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3333  protein of unknown function DUF88  29.41 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.258648  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4859  hypothetical protein  28.02 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0181079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2722  hypothetical protein  28.02 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353362  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4033  protein of unknown function DUF88  28.74 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.424874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3991  protein of unknown function DUF88  28.74 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0671  hypothetical protein  28.05 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2805  hypothetical protein  30.23 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2275  protein of unknown function DUF88  31.51 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0096  protein of unknown function DUF88  27.14 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.263134 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1943  hypothetical protein  29.76 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.423508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1911  protein of unknown function DUF88  27.27 
 
 		 484 aa  58.5  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1143  hypothetical protein  28.8 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2746  protein of unknown function DUF88  27.98 
 
 		 165 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0482662  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0945  hypothetical protein  28.93 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.279417 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2943  hypothetical protein  28.26 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0224  protein of unknown function DUF88  29.52 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121246  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2466  hypothetical protein  30.3 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2568  hypothetical protein  38.33 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1000  protein of unknown function DUF88  28.89 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0796  protein of unknown function DUF88  27.38 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3179  protein of unknown function DUF88  30.19 
 
 		 165 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.488088  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2447  hypothetical protein  28.33 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3359  hypothetical protein  28.57 
 
 		 404 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1444  hypothetical protein  25.29 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0443  hypothetical protein  36.36 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220081  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  27.08 
 
 		 183 aa  51.2  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  27.41 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1877  hypothetical protein  27.17 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000471771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1893  hypothetical protein  26.37 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  hitchhiker  0.00176101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1723  hypothetical protein  29.48 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.761661  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1195  protein of unknown function DUF88  26.11 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1733  protein of unknown function DUF88  36.11 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.131677  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0673  protein of unknown function DUF88  25.45 
 
 		 165 aa  49.3  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.696503  normal  0.0525429 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0944  hypothetical protein  25 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0294476  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2303  protein of unknown function DUF88  28.24 
 
 		 168 aa  48.5  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1859  hypothetical protein  25.75 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00561567  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2638  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  48.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2384  hypothetical protein  22.12 
 
 		 218 aa  48.1  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.857348  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3517  protein of unknown function DUF88  24.28 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650346 
 
 
-
 
NC_004310  BR0649  hypothetical protein  24.42 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3193  hypothetical protein  24.28 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.951691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0029  hypothetical protein  29.03 
 
 		 271 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0528  hypothetical protein  28.89 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0275005  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1300  protein of unknown function DUF88  27.78 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000638541  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2865  hypothetical protein  24.4 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414585  normal  0.0571664 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1924  hypothetical protein  23.2 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1440  hypothetical protein  26.49 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  26.49 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2257  hypothetical protein  24.55 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3389  protein of unknown function DUF88  25 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0165  protein of unknown function DUF88  36.84 
 
 		 343 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.334163 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  31.97 
 
 		 287 aa  45.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4132  protein of unknown function DUF88  31.58 
 
 		 333 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2633  hypothetical protein  24.55 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0521932  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0698  hypothetical protein  32.11 
 
 		 304 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1465  hypothetical protein  23.84 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0226  protein of unknown function DUF88  26.29 
 
 		 446 aa  45.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1318  hypothetical protein  32.11 
 
 		 313 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0991  protein of unknown function DUF88  26.49 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  27.27 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  24.4 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  26.49 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2966  protein of unknown function DUF88  24.7 
 
 		 216 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  26.7 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4689  hypothetical protein  23.35 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501693  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5741  protein of unknown function DUF88  28.15 
 
 		 435 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2645  hypothetical protein  24.1 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  hitchhiker  0.00814137 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  26.7 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00589  hypothetical protein  24.42 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0183  hypothetical protein  27.21 
 
 		 468 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0923837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  26.7 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2606  hypothetical protein  24.22 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0253982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0379  protein of unknown function DUF88  23.89 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.31368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  30.39 
 
 		 249 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4264  protein of unknown function DUF88  30.38 
 
 		 261 aa  42.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.110451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1693  hypothetical protein  43.18 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2418  hypothetical protein  40.91 
 
 		 247 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0035  protein of unknown function DUF88  24.57 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153842  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0791  hypothetical protein  30.1 
 
 		 335 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1985  cold shock protein  31.88 
 
 		 310 aa  42.4  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1578  hypothetical protein  28.57 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0544432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2825  hypothetical protein  40.91 
 
 		 244 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  37.68 
 
 		 432 aa  42.4  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2873  protein of unknown function DUF88  26.82 
 
 		 213 aa  42  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0033  hypothetical protein  24 
 
 		 216 aa  41.6  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0758  hypothetical protein  26.16 
 
 		 158 aa  41.6  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6243  hypothetical protein  25.29 
 
 		 272 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.77662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>