19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1444 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1444  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2943  hypothetical protein  36.89 
 
 
212 aa  131  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2384  hypothetical protein  34.63 
 
 
218 aa  106  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.857348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1670  hypothetical protein  30.86 
 
 
244 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244551  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5599  hypothetical protein  28.91 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000732573  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1576  hypothetical protein  28.44 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0028  hypothetical protein  28.74 
 
 
317 aa  72.4  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0987  hypothetical protein  30.93 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.305876 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8422  hypothetical protein  30.09 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2020  hypothetical protein  26.41 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0887  hypothetical protein  34.59 
 
 
136 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0275  hypothetical protein  31.98 
 
 
311 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  25.29 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_287  hypothetical protein  24.71 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000717319  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  25.29 
 
 
194 aa  52.4  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4114  hypothetical protein  25.22 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1107  hypothetical protein  27.48 
 
 
246 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0628147  normal  0.0453857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  25.44 
 
 
181 aa  42.4  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4264  protein of unknown function DUF88  37.7 
 
 
261 aa  42  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.110451 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>