21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2943 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2943  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1444  hypothetical protein  36.89 
 
 		 221 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2384  hypothetical protein  34.4 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.857348  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0028  hypothetical protein  35.83 
 
 		 317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0987  hypothetical protein  40.76 
 
 		 234 aa  111  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305876 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0275  hypothetical protein  33.76 
 
 		 311 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5599  hypothetical protein  32.14 
 
 		 243 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000732573  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8422  hypothetical protein  34.68 
 
 		 204 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1670  hypothetical protein  32.34 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244551  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0887  hypothetical protein  39.17 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1107  hypothetical protein  29.65 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0628147  normal  0.0453857 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1576  hypothetical protein  27.36 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4114  hypothetical protein  29.5 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2020  hypothetical protein  28.96 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  28.49 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_287  hypothetical protein  28.26 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000717319  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  28.26 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  28.09 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0543  hypothetical protein  27.17 
 
 		 180 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0589546  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  27.68 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2514  hypothetical protein  25.97 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0312456  normal  0.44225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>