17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2384 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2384  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  447  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.857348  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0987  hypothetical protein  36.16 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305876 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0028  hypothetical protein  33.61 
 
 		 317 aa  118  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2943  hypothetical protein  34.4 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1444  hypothetical protein  34.63 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0275  hypothetical protein  30.8 
 
 		 311 aa  97.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1670  hypothetical protein  28.74 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244551  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8422  hypothetical protein  30.73 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5599  hypothetical protein  28.69 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000732573  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0887  hypothetical protein  36.36 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1576  hypothetical protein  21.26 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0543  hypothetical protein  24.26 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0589546  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2020  hypothetical protein  27.98 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  22.12 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_287  hypothetical protein  23.39 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000717319  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  21.97 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1107  hypothetical protein  25.24 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0628147  normal  0.0453857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>