12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0028 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0028  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  650    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0275  hypothetical protein  57.69 
 
 		 311 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0987  hypothetical protein  38.21 
 
 		 234 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305876 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2384  hypothetical protein  33.61 
 
 		 218 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.857348  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2943  hypothetical protein  35.83 
 
 		 212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1444  hypothetical protein  28.74 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5599  hypothetical protein  24.81 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000732573  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1670  hypothetical protein  26.04 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244551  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1576  hypothetical protein  26.42 
 
 		 209 aa  55.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8422  hypothetical protein  27.01 
 
 		 204 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0887  hypothetical protein  26.24 
 
 		 136 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2020  hypothetical protein  24.42 
 
 		 212 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>