18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8422 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8422  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  424  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4114  hypothetical protein  36.59 
 
 		 246 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1107  hypothetical protein  35.61 
 
 		 246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0628147  normal  0.0453857 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1576  hypothetical protein  32.67 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2020  hypothetical protein  35.44 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2943  hypothetical protein  34.68 
 
 		 212 aa  84.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0887  hypothetical protein  37.5 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0543  hypothetical protein  28.57 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0589546  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1444  hypothetical protein  30.09 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2384  hypothetical protein  30.73 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.857348  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0987  hypothetical protein  27.12 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1670  hypothetical protein  26.29 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244551  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  25.17 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5599  hypothetical protein  26.07 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000732573  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0028  hypothetical protein  27.01 
 
 		 317 aa  49.3  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2303  protein of unknown function DUF88  27.27 
 
 		 168 aa  46.2  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0275  hypothetical protein  25.75 
 
 		 311 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  22.86 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>