165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1195 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1195  protein of unknown function DUF88  100 
 
 		 176 aa  353  5e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  34.87 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0433  protein of unknown function DUF88  41.38 
 
 		 294 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1143  hypothetical protein  35.4 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0096  protein of unknown function DUF88  34.3 
 
 		 201 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.263134 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4859  hypothetical protein  35.95 
 
 		 210 aa  98.6  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0181079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2722  hypothetical protein  35.95 
 
 		 209 aa  98.2  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353362  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2008  protein of unknown function DUF88  36.36 
 
 		 304 aa  97.8  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2303  protein of unknown function DUF88  32.9 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0482  hypothetical protein  35.62 
 
 		 287 aa  96.3  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1805  hypothetical protein  34.84 
 
 		 204 aa  95.1  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000048787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3991  protein of unknown function DUF88  34.87 
 
 		 226 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  35.44 
 
 		 287 aa  93.6  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4033  protein of unknown function DUF88  34.87 
 
 		 226 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.424874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3333  protein of unknown function DUF88  34.44 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.258648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1859  hypothetical protein  33.14 
 
 		 214 aa  92  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00561567  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1924  hypothetical protein  31.32 
 
 		 205 aa  91.7  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1873  protein of unknown function DUF88  34.5 
 
 		 178 aa  91.3  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1847  protein of unknown function DUF88  34.5 
 
 		 178 aa  91.3  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2257  hypothetical protein  33.52 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2865  hypothetical protein  32.75 
 
 		 206 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414585  normal  0.0571664 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2606  hypothetical protein  34.12 
 
 		 209 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0253982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1891  hypothetical protein  33.73 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248989  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3645  protein of unknown function DUF88  34.68 
 
 		 180 aa  87.8  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0528  hypothetical protein  33.72 
 
 		 190 aa  87.8  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0275005  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1893  hypothetical protein  35 
 
 		 213 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  hitchhiker  0.00176101 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2466  hypothetical protein  28.66 
 
 		 228 aa  85.5  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2966  protein of unknown function DUF88  33.53 
 
 		 216 aa  85.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4688  protein of unknown function DUF88  33.95 
 
 		 172 aa  85.1  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.706781  normal  0.898673 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2633  hypothetical protein  33.94 
 
 		 208 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0521932  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2110  hypothetical protein  33.94 
 
 		 173 aa  84.3  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850864  normal  0.350459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4689  hypothetical protein  31.64 
 
 		 217 aa  84.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501693  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2645  hypothetical protein  33.53 
 
 		 228 aa  84.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  hitchhiker  0.00814137 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4322  hypothetical protein  33.94 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2447  hypothetical protein  30.56 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4322  hypothetical protein  33.94 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.833366  normal  0.664553 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  31.32 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2638  hypothetical protein  31.07 
 
 		 191 aa  80.9  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0379  protein of unknown function DUF88  30.64 
 
 		 203 aa  80.9  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.31368  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0649  hypothetical protein  30.51 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3517  protein of unknown function DUF88  30.99 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3193  hypothetical protein  30.99 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.951691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3836  hypothetical protein  29.38 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0165  protein of unknown function DUF88  28.39 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.334163 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1440  hypothetical protein  29.38 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3389  protein of unknown function DUF88  30.99 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1943  hypothetical protein  28.9 
 
 		 236 aa  77.8  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.423508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0944  hypothetical protein  29.38 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0294476  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2873  protein of unknown function DUF88  29.33 
 
 		 213 aa  77.4  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0991  protein of unknown function DUF88  28.25 
 
 		 195 aa  77.4  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  33.54 
 
 		 190 aa  77.4  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  28.25 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1877  hypothetical protein  29.59 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000471771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1000  protein of unknown function DUF88  30.49 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  33.54 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0033  hypothetical protein  28.98 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0035  protein of unknown function DUF88  28.98 
 
 		 219 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153842  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1723  hypothetical protein  28.02 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.761661  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  31.76 
 
 		 189 aa  72  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_008347  Mmar10_1578  hypothetical protein  34.86 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0544432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  30.23 
 
 		 190 aa  72  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  30.23 
 
 		 190 aa  72  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  30.23 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3179  protein of unknown function DUF88  27.95 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.488088  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5380  protein of unknown function DUF88  28.86 
 
 		 356 aa  71.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.458157 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  30 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0511  hypothetical protein  31.25 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0945  hypothetical protein  25.62 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.279417 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2781  hypothetical protein  27.81 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1654  protein of unknown function DUF88  26.95 
 
 		 195 aa  67  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0466931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2746  protein of unknown function DUF88  25.97 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0482662  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0796  protein of unknown function DUF88  25.97 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0673  protein of unknown function DUF88  25.64 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.696503  normal  0.0525429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0671  hypothetical protein  25.86 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1288  hypothetical protein  26.32 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000264072  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1157  hypothetical protein  28.21 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111181  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3730  hypothetical protein  29.61 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05689  hypothetical protein  27.98 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000074  hypothetical protein  29.34 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0224  protein of unknown function DUF88  24.38 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12750  hypothetical protein  27.56 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4925  hypothetical protein  28.1 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2805  hypothetical protein  24.26 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00589  hypothetical protein  28.67 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  24.86 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0526  hypothetical protein  28.3 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  41.89 
 
 		 432 aa  57.8  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0758  hypothetical protein  28.67 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0893  hypothetical protein  27.5 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  25.64 
 
 		 487 aa  55.5  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1710  hypothetical protein  26 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1028  hypothetical protein  31.58 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.873196  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  27.39 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1407  hypothetical protein  30.39 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0652  hypothetical protein  26.14 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00256756  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4666  hypothetical protein  26.8 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  39.19 
 
 		 260 aa  54.7  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1362  hypothetical protein  27.92 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0533358  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4301  hypothetical protein  26.8 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000509766  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3118  hypothetical protein  31.15 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.26612 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>