33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0698 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0698  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1318  hypothetical protein  81.53 
 
 		 313 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4132  protein of unknown function DUF88  64.55 
 
 		 333 aa  408  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0791  hypothetical protein  60.49 
 
 		 335 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5741  protein of unknown function DUF88  43.17 
 
 		 435 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1151  hypothetical protein  37.7 
 
 		 388 aa  121  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.111113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0183  hypothetical protein  36.32 
 
 		 468 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0923837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3359  hypothetical protein  37.1 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1911  protein of unknown function DUF88  39.87 
 
 		 484 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0396  hypothetical protein  34.86 
 
 		 393 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2603  hypothetical protein  27.57 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0226  protein of unknown function DUF88  36.72 
 
 		 446 aa  96.7  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3005  hypothetical protein  34.29 
 
 		 516 aa  95.5  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4611  protein of unknown function DUF88  34.68 
 
 		 574 aa  82.4  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0253473  normal  0.838732 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  29.59 
 
 		 181 aa  57  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1124  hypothetical protein  28.76 
 
 		 180 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.355557  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  31.82 
 
 		 194 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_287  hypothetical protein  32.11 
 
 		 194 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000717319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0543  hypothetical protein  28.3 
 
 		 180 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0589546  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2275  protein of unknown function DUF88  32.43 
 
 		 188 aa  46.6  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  32.11 
 
 		 194 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1748  hypothetical protein  31.11 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0443  hypothetical protein  24.56 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2633  hypothetical protein  27.85 
 
 		 208 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0521932  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1924  hypothetical protein  27.73 
 
 		 205 aa  44.3  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2418  hypothetical protein  36 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0106  hypothetical protein  29.25 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000384209  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0029  hypothetical protein  37.29 
 
 		 271 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2825  hypothetical protein  34.09 
 
 		 244 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2645  hypothetical protein  27.27 
 
 		 228 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  hitchhiker  0.00814137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1693  hypothetical protein  41.51 
 
 		 236 aa  42.7  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2257  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  42.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4689  hypothetical protein  28.4 
 
 		 217 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501693  normal  0.101496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>