25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0396 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0396  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  790    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0183  hypothetical protein  76.24 
 
 		 468 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0923837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0226  protein of unknown function DUF88  73.13 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3005  hypothetical protein  60.39 
 
 		 516 aa  266  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4611  protein of unknown function DUF88  64.18 
 
 		 574 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0253473  normal  0.838732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5741  protein of unknown function DUF88  37.14 
 
 		 435 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1151  hypothetical protein  27.65 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.111113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3359  hypothetical protein  38.79 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1911  protein of unknown function DUF88  37.95 
 
 		 484 aa  106  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4132  protein of unknown function DUF88  36.7 
 
 		 333 aa  99.8  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0698  hypothetical protein  34.86 
 
 		 304 aa  96.7  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0791  hypothetical protein  29.96 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1318  hypothetical protein  32.76 
 
 		 313 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2603  hypothetical protein  32.05 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1748  hypothetical protein  29.57 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  30.17 
 
 		 195 aa  59.7  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  34.46 
 
 		 181 aa  53.9  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  27.19 
 
 		 2449 aa  47  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1893  hypothetical protein  25.91 
 
 		 213 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  hitchhiker  0.00176101 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  31.54 
 
 		 2914 aa  45.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1000  protein of unknown function DUF88  28 
 
 		 205 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0033  hypothetical protein  27.32 
 
 		 216 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2447  hypothetical protein  26.86 
 
 		 203 aa  43.9  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1859  hypothetical protein  28.57 
 
 		 214 aa  43.9  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00561567  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3389  protein of unknown function DUF88  23.85 
 
 		 217 aa  42.7  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>