33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4132 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4132  protein of unknown function DUF88  100 
 
 		 333 aa  671    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1318  hypothetical protein  64.72 
 
 		 313 aa  401  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0698  hypothetical protein  64.24 
 
 		 304 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0791  hypothetical protein  58.9 
 
 		 335 aa  352  4e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5741  protein of unknown function DUF88  45.76 
 
 		 435 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3359  hypothetical protein  35.53 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1911  protein of unknown function DUF88  43.51 
 
 		 484 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1151  hypothetical protein  38.1 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.111113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0183  hypothetical protein  35.75 
 
 		 468 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0923837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0226  protein of unknown function DUF88  39.44 
 
 		 446 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0396  hypothetical protein  36.7 
 
 		 393 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3005  hypothetical protein  36.67 
 
 		 516 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2603  hypothetical protein  37.58 
 
 		 277 aa  93.2  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4611  protein of unknown function DUF88  34.29 
 
 		 574 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0253473  normal  0.838732 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  32.87 
 
 		 181 aa  52.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2275  protein of unknown function DUF88  27.66 
 
 		 188 aa  49.7  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0543  hypothetical protein  27.67 
 
 		 180 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0589546  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  30.57 
 
 		 190 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  31.53 
 
 		 194 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  31.58 
 
 		 194 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2447  hypothetical protein  25.71 
 
 		 203 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  28.16 
 
 		 190 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  28.16 
 
 		 190 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_287  hypothetical protein  31.58 
 
 		 194 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000717319  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  28.16 
 
 		 190 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1693  hypothetical protein  41.51 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2418  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0106  hypothetical protein  22.06 
 
 		 240 aa  43.9  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000384209  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3517  protein of unknown function DUF88  27.27 
 
 		 218 aa  43.5  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3193  hypothetical protein  27.27 
 
 		 218 aa  43.5  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.951691 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2825  hypothetical protein  32.47 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1748  hypothetical protein  31.67 
 
 		 284 aa  43.5  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1124  hypothetical protein  36 
 
 		 180 aa  42.7  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.355557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>