19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2418 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2418  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  508  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2825  hypothetical protein  67.66 
 
 		 244 aa  329  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1693  hypothetical protein  61.29 
 
 		 236 aa  298  8e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0029  hypothetical protein  39.93 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22170  hypothetical protein  41.3 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0106  hypothetical protein  36.64 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000384209  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1124  hypothetical protein  39.29 
 
 		 180 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.355557  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2212  hypothetical protein  33.19 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.526644  normal  0.367498 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2275  protein of unknown function DUF88  33.33 
 
 		 188 aa  49.3  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1911  protein of unknown function DUF88  35.14 
 
 		 484 aa  48.9  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1465  hypothetical protein  26.95 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0543  hypothetical protein  27.08 
 
 		 180 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0589546  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4132  protein of unknown function DUF88  33.33 
 
 		 333 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0698  hypothetical protein  36 
 
 		 304 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  40.91 
 
 		 194 aa  42.7  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  40.91 
 
 		 194 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_287  hypothetical protein  40.91 
 
 		 194 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000717319  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0443  hypothetical protein  40 
 
 		 216 aa  42  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1318  hypothetical protein  34.67 
 
 		 313 aa  42  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.557208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>