17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0029 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0029  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  558  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2418  hypothetical protein  39.93 
 
 
247 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2825  hypothetical protein  42.16 
 
 
244 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1693  hypothetical protein  41.25 
 
 
236 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22170  hypothetical protein  34.34 
 
 
247 aa  144  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0106  hypothetical protein  28.63 
 
 
240 aa  112  5e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000384209  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1124  hypothetical protein  48.24 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.355557  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2212  hypothetical protein  27.82 
 
 
201 aa  63.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.526644  normal  0.367498 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1465  hypothetical protein  45.1 
 
 
188 aa  47.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2275  protein of unknown function DUF88  44.68 
 
 
188 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  29.03 
 
 
194 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1911  protein of unknown function DUF88  42 
 
 
484 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_287  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000717319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1300  protein of unknown function DUF88  32.61 
 
 
208 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000638541  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0443  hypothetical protein  41.18 
 
 
216 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220081  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0698  hypothetical protein  37.29 
 
 
304 aa  43.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>