16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1124 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1124  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  368  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.355557  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0106  hypothetical protein  66.5 
 
 
240 aa  266  2e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000384209  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22170  hypothetical protein  40.76 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2825  hypothetical protein  40.48 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1693  hypothetical protein  37.31 
 
 
236 aa  113  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2418  hypothetical protein  39.29 
 
 
247 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2212  hypothetical protein  43.7 
 
 
201 aa  96.3  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.526644  normal  0.367498 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0029  hypothetical protein  48.24 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2275  protein of unknown function DUF88  35.54 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1911  protein of unknown function DUF88  40.58 
 
 
484 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0698  hypothetical protein  37.5 
 
 
304 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  31.03 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1318  hypothetical protein  35 
 
 
313 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1465  hypothetical protein  32.17 
 
 
188 aa  45.4  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4132  protein of unknown function DUF88  36 
 
 
333 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0543  hypothetical protein  32.86 
 
 
180 aa  41.2  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0589546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>