15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2212 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2212  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  416  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.526644  normal  0.367498 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0106  hypothetical protein  35.02 
 
 
240 aa  99.4  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000384209  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22170  hypothetical protein  33.87 
 
 
247 aa  96.7  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1124  hypothetical protein  43.7 
 
 
180 aa  96.3  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.355557  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2825  hypothetical protein  34.84 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2418  hypothetical protein  33.19 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2275  protein of unknown function DUF88  31.49 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1693  hypothetical protein  31.7 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0029  hypothetical protein  27.82 
 
 
271 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  27.72 
 
 
181 aa  51.6  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1911  protein of unknown function DUF88  36.62 
 
 
484 aa  50.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1465  hypothetical protein  34.57 
 
 
188 aa  49.3  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0543  hypothetical protein  27.93 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0589546  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1151  hypothetical protein  25.44 
 
 
388 aa  42.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.111113  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0698  hypothetical protein  35.53 
 
 
304 aa  41.6  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>