141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1859 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1859  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  433  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00561567  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2865  hypothetical protein  75.96 
 
 		 206 aa  291  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414585  normal  0.0571664 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2257  hypothetical protein  66.17 
 
 		 206 aa  282  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2645  hypothetical protein  66.01 
 
 		 228 aa  279  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  hitchhiker  0.00814137 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1000  protein of unknown function DUF88  68.84 
 
 		 205 aa  278  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2447  hypothetical protein  77.98 
 
 		 203 aa  278  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1924  hypothetical protein  66 
 
 		 205 aa  278  6e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2606  hypothetical protein  65.2 
 
 		 209 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0253982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2966  protein of unknown function DUF88  62.26 
 
 		 216 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180481  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2633  hypothetical protein  70.29 
 
 		 208 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0521932  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  71.67 
 
 		 190 aa  272  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  71.67 
 
 		 190 aa  272  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  71.67 
 
 		 190 aa  272  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4689  hypothetical protein  69.32 
 
 		 217 aa  271  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501693  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  67.38 
 
 		 189 aa  269  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_007802  Jann_0511  hypothetical protein  72.09 
 
 		 191 aa  269  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  65.59 
 
 		 193 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  70.35 
 
 		 190 aa  266  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  68.85 
 
 		 183 aa  266  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3836  hypothetical protein  68.39 
 
 		 202 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0991  protein of unknown function DUF88  63.54 
 
 		 195 aa  265  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  66.67 
 
 		 193 aa  264  8.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3517  protein of unknown function DUF88  69.54 
 
 		 218 aa  263  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3193  hypothetical protein  69.54 
 
 		 218 aa  263  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.951691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1723  hypothetical protein  63.93 
 
 		 207 aa  261  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.761661  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1440  hypothetical protein  66.29 
 
 		 192 aa  260  8.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3389  protein of unknown function DUF88  68.39 
 
 		 217 aa  259  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1893  hypothetical protein  62.7 
 
 		 213 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  hitchhiker  0.00176101 
 
 
-
 
NC_004310  BR0649  hypothetical protein  64.44 
 
 		 191 aa  258  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2638  hypothetical protein  61.11 
 
 		 191 aa  258  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0528  hypothetical protein  61.14 
 
 		 190 aa  255  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0275005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0035  protein of unknown function DUF88  69.64 
 
 		 219 aa  255  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153842  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0944  hypothetical protein  63.3 
 
 		 194 aa  255  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0294476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0033  hypothetical protein  69.05 
 
 		 216 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0379  protein of unknown function DUF88  55.17 
 
 		 203 aa  248  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.31368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1578  hypothetical protein  63.07 
 
 		 179 aa  236  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0544432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1877  hypothetical protein  63.22 
 
 		 194 aa  231  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000471771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  39.77 
 
 		 194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1143  hypothetical protein  39.25 
 
 		 198 aa  118  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3645  protein of unknown function DUF88  37.08 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1847  protein of unknown function DUF88  38.64 
 
 		 178 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1873  protein of unknown function DUF88  38.64 
 
 		 178 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2110  hypothetical protein  38.86 
 
 		 173 aa  115  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850864  normal  0.350459 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4859  hypothetical protein  35.78 
 
 		 210 aa  115  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0181079  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1805  hypothetical protein  34.87 
 
 		 204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000048787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2722  hypothetical protein  36.08 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353362  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3333  protein of unknown function DUF88  38.12 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.258648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4033  protein of unknown function DUF88  37.02 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.424874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3991  protein of unknown function DUF88  37.02 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4322  hypothetical protein  38.6 
 
 		 171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.833366  normal  0.664553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4688  protein of unknown function DUF88  37.43 
 
 		 172 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.706781  normal  0.898673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4322  hypothetical protein  38.15 
 
 		 173 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1943  hypothetical protein  40.57 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.423508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1891  hypothetical protein  39.11 
 
 		 186 aa  106  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248989  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0096  protein of unknown function DUF88  33.85 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.263134 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2466  hypothetical protein  37.13 
 
 		 228 aa  101  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2303  protein of unknown function DUF88  35.8 
 
 		 168 aa  96.7  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2008  protein of unknown function DUF88  38.89 
 
 		 304 aa  94.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888225  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2805  hypothetical protein  38.18 
 
 		 189 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1195  protein of unknown function DUF88  33.14 
 
 		 176 aa  91.3  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0433  protein of unknown function DUF88  36.17 
 
 		 294 aa  90.5  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0482  hypothetical protein  36.88 
 
 		 287 aa  89.4  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  37.14 
 
 		 287 aa  88.2  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0526  hypothetical protein  32.14 
 
 		 295 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2746  protein of unknown function DUF88  33.94 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0482662  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0796  protein of unknown function DUF88  32.73 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0671  hypothetical protein  32.35 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1080  hypothetical protein  31.45 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0663  hypothetical protein  34.15 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0812  protein of unknown function DUF88  34.15 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1080  hypothetical protein  31.48 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0165  protein of unknown function DUF88  32.69 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.334163 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2873  protein of unknown function DUF88  31.28 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0224  protein of unknown function DUF88  33.99 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121246  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0673  protein of unknown function DUF88  31.18 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.696503  normal  0.0525429 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0945  hypothetical protein  34.44 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.279417 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2781  hypothetical protein  29.61 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3179  protein of unknown function DUF88  32.35 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.488088  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1148  hypothetical protein  31.01 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.882158  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5380  protein of unknown function DUF88  32.5 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.458157 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3118  hypothetical protein  29.94 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.26612 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1654  protein of unknown function DUF88  33.57 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0466931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0372  hypothetical protein  31.65 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000170684  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  30 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4666  hypothetical protein  31.01 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12750  hypothetical protein  31.25 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3258  hypothetical protein  32.81 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1173  hypothetical protein  30.57 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.751958 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2790  hypothetical protein  29.94 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1157  hypothetical protein  30.63 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4301  hypothetical protein  31.01 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000509766  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1710  hypothetical protein  28.3 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3176  hypothetical protein  29.94 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1028  hypothetical protein  28.48 
 
 		 157 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.873196  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1195  protein of unknown function DUF88  29.94 
 
 		 157 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3175  hypothetical protein  29.94 
 
 		 157 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3319  hypothetical protein  29.94 
 
 		 157 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  32.04 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4925  hypothetical protein  29.11 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1154  hypothetical protein  29.38 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.215618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>