91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2873 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2873  protein of unknown function DUF88  100 
 
 
213 aa  432  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2781  hypothetical protein  65.55 
 
 
190 aa  281  8.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130399  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  43.29 
 
 
194 aa  138  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1891  hypothetical protein  37.95 
 
 
186 aa  99.4  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248989  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4322  hypothetical protein  34.94 
 
 
173 aa  99  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2110  hypothetical protein  32.54 
 
 
173 aa  98.6  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850864  normal  0.350459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4688  protein of unknown function DUF88  32.12 
 
 
172 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.706781  normal  0.898673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3645  protein of unknown function DUF88  32.73 
 
 
180 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4322  hypothetical protein  34.15 
 
 
171 aa  97.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.833366  normal  0.664553 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2466  hypothetical protein  31.21 
 
 
228 aa  95.5  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1847  protein of unknown function DUF88  32.12 
 
 
178 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1873  protein of unknown function DUF88  32.12 
 
 
178 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1943  hypothetical protein  29.35 
 
 
236 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.423508  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0096  protein of unknown function DUF88  30.77 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.263134 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4033  protein of unknown function DUF88  30.59 
 
 
226 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.424874  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3991  protein of unknown function DUF88  30.59 
 
 
226 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4859  hypothetical protein  31.14 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0181079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2722  hypothetical protein  31.14 
 
 
209 aa  88.2  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353362  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1805  hypothetical protein  30 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000048787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3333  protein of unknown function DUF88  31.01 
 
 
207 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.258648  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2303  protein of unknown function DUF88  30.91 
 
 
168 aa  87.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1143  hypothetical protein  32.28 
 
 
198 aa  86.7  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1723  hypothetical protein  30.53 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.761661  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0379  protein of unknown function DUF88  31.43 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.31368  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2865  hypothetical protein  31.46 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414585  normal  0.0571664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1859  hypothetical protein  31.28 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00561567  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3836  hypothetical protein  34.81 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1195  protein of unknown function DUF88  29.33 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1877  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000471771  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1000  protein of unknown function DUF88  32 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0033  hypothetical protein  30.41 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2447  hypothetical protein  32 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2633  hypothetical protein  29.44 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0521932  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4689  hypothetical protein  31.61 
 
 
217 aa  74.7  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501693  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1440  hypothetical protein  30.37 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2645  hypothetical protein  29.74 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  hitchhiker  0.00814137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  30.34 
 
 
193 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1893  hypothetical protein  28.81 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  hitchhiker  0.00176101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2257  hypothetical protein  32.18 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1924  hypothetical protein  32.57 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  31.36 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  31.36 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3517  protein of unknown function DUF88  28.11 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0650346 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  31.36 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3193  hypothetical protein  28.11 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.951691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2606  hypothetical protein  31.03 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0253982  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0528  hypothetical protein  31.18 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0275005  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3389  protein of unknown function DUF88  29.68 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2966  protein of unknown function DUF88  31.36 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180481  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  31.14 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  29.21 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0991  protein of unknown function DUF88  29.31 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0035  protein of unknown function DUF88  30.34 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153842  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  28.99 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_007802  Jann_0511  hypothetical protein  29.34 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  29.7 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0944  hypothetical protein  27.89 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0294476  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2638  hypothetical protein  30.29 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0649  hypothetical protein  29.71 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  25.77 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0433  protein of unknown function DUF88  26.36 
 
 
294 aa  62.4  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5380  protein of unknown function DUF88  28.48 
 
 
356 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.458157 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  26.4 
 
 
287 aa  60.1  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0482  hypothetical protein  29.19 
 
 
287 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2008  protein of unknown function DUF88  25 
 
 
304 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888225  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0165  protein of unknown function DUF88  27.33 
 
 
343 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.334163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1578  hypothetical protein  28.4 
 
 
179 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0544432  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2746  protein of unknown function DUF88  23.68 
 
 
165 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0482662  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  31.06 
 
 
181 aa  52.8  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0796  protein of unknown function DUF88  23.03 
 
 
165 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3118  hypothetical protein  28.38 
 
 
157 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.26612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1157  hypothetical protein  28.76 
 
 
167 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111181  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4666  hypothetical protein  28.1 
 
 
158 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1148  hypothetical protein  27.15 
 
 
157 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.882158  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  24.5 
 
 
487 aa  45.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12750  hypothetical protein  28.1 
 
 
167 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019537  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1028  hypothetical protein  27.33 
 
 
157 aa  45.1  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.873196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4301  hypothetical protein  27.45 
 
 
158 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000509766  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3258  hypothetical protein  25.55 
 
 
157 aa  44.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1080  hypothetical protein  27.7 
 
 
170 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0945  hypothetical protein  27.16 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.279417 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2805  hypothetical protein  25.77 
 
 
189 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0652  hypothetical protein  26.49 
 
 
159 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00256756  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  26.82 
 
 
194 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  31.03 
 
 
408 aa  42  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_287  hypothetical protein  27.78 
 
 
194 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000717319  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  26.82 
 
 
194 aa  42  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3730  hypothetical protein  27.54 
 
 
159 aa  42  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4644  hypothetical protein  26.49 
 
 
159 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.54947  normal  0.0402437 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4769  hypothetical protein  26.49 
 
 
159 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40399  hitchhiker  0.00938493 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3490  hypothetical protein  25.32 
 
 
157 aa  41.6  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>