137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2008 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2008  protein of unknown function DUF88  100 
 
 		 304 aa  624  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  56.29 
 
 		 287 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0482  hypothetical protein  58.01 
 
 		 287 aa  312  4.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0433  protein of unknown function DUF88  56.68 
 
 		 294 aa  310  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2110  hypothetical protein  37.65 
 
 		 173 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850864  normal  0.350459 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0528  hypothetical protein  38.59 
 
 		 190 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0275005  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4688  protein of unknown function DUF88  37.27 
 
 		 172 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.706781  normal  0.898673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4322  hypothetical protein  37.65 
 
 		 173 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3645  protein of unknown function DUF88  38.36 
 
 		 180 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1873  protein of unknown function DUF88  37.2 
 
 		 178 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4322  hypothetical protein  37.04 
 
 		 171 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.833366  normal  0.664553 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2865  hypothetical protein  41.67 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414585  normal  0.0571664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1847  protein of unknown function DUF88  37.2 
 
 		 178 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0033  hypothetical protein  41.38 
 
 		 216 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1000  protein of unknown function DUF88  38.33 
 
 		 205 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0035  protein of unknown function DUF88  37.78 
 
 		 219 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153842  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1891  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  103  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248989  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2447  hypothetical protein  37.99 
 
 		 203 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0511  hypothetical protein  41.67 
 
 		 191 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4689  hypothetical protein  43.75 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501693  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3193  hypothetical protein  36.14 
 
 		 218 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.951691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3517  protein of unknown function DUF88  36.14 
 
 		 218 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2633  hypothetical protein  43.97 
 
 		 208 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0521932  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  41.55 
 
 		 193 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1440  hypothetical protein  42.25 
 
 		 192 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2257  hypothetical protein  44.68 
 
 		 206 aa  99.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1893  hypothetical protein  40.28 
 
 		 213 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  hitchhiker  0.00176101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3389  protein of unknown function DUF88  42.25 
 
 		 217 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2966  protein of unknown function DUF88  41.1 
 
 		 216 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180481  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1924  hypothetical protein  43.97 
 
 		 205 aa  99.4  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2645  hypothetical protein  43.26 
 
 		 228 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  hitchhiker  0.00814137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0944  hypothetical protein  35.2 
 
 		 194 aa  99.4  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0294476  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2638  hypothetical protein  40.41 
 
 		 191 aa  99.4  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2303  protein of unknown function DUF88  34.59 
 
 		 168 aa  99  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  40.85 
 
 		 193 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0991  protein of unknown function DUF88  40.85 
 
 		 195 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_004310  BR0649  hypothetical protein  39.73 
 
 		 191 aa  99  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2606  hypothetical protein  42.96 
 
 		 209 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0253982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1195  protein of unknown function DUF88  36.36 
 
 		 176 aa  97.8  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  40.97 
 
 		 189 aa  96.3  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  41.26 
 
 		 190 aa  95.5  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1877  hypothetical protein  36.11 
 
 		 194 aa  95.5  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000471771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  39.58 
 
 		 190 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1859  hypothetical protein  38.89 
 
 		 214 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00561567  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  39.58 
 
 		 190 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  39.58 
 
 		 190 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0379  protein of unknown function DUF88  36.11 
 
 		 203 aa  90.9  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.31368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  37.06 
 
 		 183 aa  90.5  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3836  hypothetical protein  37.16 
 
 		 202 aa  90.1  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1723  hypothetical protein  36.81 
 
 		 207 aa  89.4  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.761661  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  30 
 
 		 194 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1578  hypothetical protein  37.5 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0544432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3333  protein of unknown function DUF88  32.21 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.258648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1805  hypothetical protein  30.77 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000048787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2722  hypothetical protein  31.54 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353362  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4859  hypothetical protein  31.54 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0181079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0096  protein of unknown function DUF88  31.54 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.263134 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1143  hypothetical protein  29.53 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4033  protein of unknown function DUF88  30.2 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.424874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3991  protein of unknown function DUF88  30.2 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0526  hypothetical protein  30.77 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1407  hypothetical protein  30.41 
 
 		 157 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00589  hypothetical protein  30.14 
 
 		 156 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000074  hypothetical protein  31.58 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1362  hypothetical protein  29.56 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0533358  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0758  hypothetical protein  30.92 
 
 		 158 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05689  hypothetical protein  30.52 
 
 		 162 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2466  hypothetical protein  26.59 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0165  protein of unknown function DUF88  30 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.334163 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0812  protein of unknown function DUF88  41.18 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0663  hypothetical protein  41.18 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1288  hypothetical protein  29.3 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000264072  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3258  hypothetical protein  30.63 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0671  hypothetical protein  29.49 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1943  hypothetical protein  28.38 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.423508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2781  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5380  protein of unknown function DUF88  25.64 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.458157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3730  hypothetical protein  28.76 
 
 		 159 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0893  hypothetical protein  30.07 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0796  protein of unknown function DUF88  28.48 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1261  hypothetical protein  27.33 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0151498 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2790  hypothetical protein  28.93 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1157  hypothetical protein  29.53 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111181  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1154  hypothetical protein  28.3 
 
 		 157 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.215618  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0372  hypothetical protein  28.48 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000170684  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2746  protein of unknown function DUF88  27.15 
 
 		 165 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0482662  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2873  protein of unknown function DUF88  25 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3118  hypothetical protein  28.3 
 
 		 157 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.26612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3176  hypothetical protein  28.3 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3175  hypothetical protein  28.3 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3319  hypothetical protein  28.3 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1195  protein of unknown function DUF88  28.3 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4769  hypothetical protein  31.08 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40399  hitchhiker  0.00938493 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1173  hypothetical protein  28.75 
 
 		 157 aa  57  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.751958 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4644  hypothetical protein  31.08 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.54947  normal  0.0402437 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0134  hypothetical protein  27.22 
 
 		 157 aa  57  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2805  hypothetical protein  24.84 
 
 		 189 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1654  protein of unknown function DUF88  26.92 
 
 		 195 aa  57  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0466931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0652  hypothetical protein  30.41 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00256756  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4782  hypothetical protein  30.41 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>