169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0489 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  100 
 
 		 287 aa  588  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0482  hypothetical protein  67.74 
 
 		 287 aa  351  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2008  protein of unknown function DUF88  56.29 
 
 		 304 aa  335  5e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888225  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0433  protein of unknown function DUF88  59.64 
 
 		 294 aa  333  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2303  protein of unknown function DUF88  37.95 
 
 		 168 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2110  hypothetical protein  35.5 
 
 		 173 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850864  normal  0.350459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4688  protein of unknown function DUF88  34.88 
 
 		 172 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.706781  normal  0.898673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4322  hypothetical protein  34.12 
 
 		 173 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4322  hypothetical protein  34.71 
 
 		 171 aa  105  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.833366  normal  0.664553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1847  protein of unknown function DUF88  34.55 
 
 		 178 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3645  protein of unknown function DUF88  34.76 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1873  protein of unknown function DUF88  34.55 
 
 		 178 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3517  protein of unknown function DUF88  35.5 
 
 		 218 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3193  hypothetical protein  35.5 
 
 		 218 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.951691 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  32.73 
 
 		 194 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2865  hypothetical protein  42.86 
 
 		 206 aa  99.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414585  normal  0.0571664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0944  hypothetical protein  38.57 
 
 		 194 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0294476  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3389  protein of unknown function DUF88  37.23 
 
 		 217 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0033  hypothetical protein  38.57 
 
 		 216 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2447  hypothetical protein  40.43 
 
 		 203 aa  96.3  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1000  protein of unknown function DUF88  40.14 
 
 		 205 aa  96.3  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0035  protein of unknown function DUF88  33.5 
 
 		 219 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153842  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1891  hypothetical protein  33.53 
 
 		 186 aa  95.5  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248989  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1893  hypothetical protein  35.33 
 
 		 213 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  hitchhiker  0.00176101 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1195  protein of unknown function DUF88  35.44 
 
 		 176 aa  93.6  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2645  hypothetical protein  37.25 
 
 		 228 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  hitchhiker  0.00814137 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0511  hypothetical protein  37.32 
 
 		 191 aa  91.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2633  hypothetical protein  38.41 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0521932  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2257  hypothetical protein  38.3 
 
 		 206 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3333  protein of unknown function DUF88  33.33 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.258648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2966  protein of unknown function DUF88  35.67 
 
 		 216 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180481  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1924  hypothetical protein  37.59 
 
 		 205 aa  90.5  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  36.88 
 
 		 193 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2638  hypothetical protein  40.29 
 
 		 191 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4689  hypothetical protein  36.88 
 
 		 217 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501693  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1440  hypothetical protein  36.88 
 
 		 192 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2606  hypothetical protein  37.68 
 
 		 209 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0253982  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0649  hypothetical protein  39.57 
 
 		 191 aa  89  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  36.17 
 
 		 193 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0379  protein of unknown function DUF88  37.41 
 
 		 203 aa  89  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.31368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0991  protein of unknown function DUF88  36.69 
 
 		 195 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1859  hypothetical protein  37.14 
 
 		 214 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00561567  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4859  hypothetical protein  31.52 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0181079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0528  hypothetical protein  40.29 
 
 		 190 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0275005  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2722  hypothetical protein  31.52 
 
 		 209 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353362  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1877  hypothetical protein  35.25 
 
 		 194 aa  86.7  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000471771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1143  hypothetical protein  32.53 
 
 		 198 aa  86.3  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1805  hypothetical protein  32.12 
 
 		 204 aa  85.9  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000048787 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  37.41 
 
 		 189 aa  84.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  37.86 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  35.92 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  35.92 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  35.92 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  35.92 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0096  protein of unknown function DUF88  31.52 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.263134 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1723  hypothetical protein  33.54 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.761661  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4033  protein of unknown function DUF88  30.3 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.424874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3991  protein of unknown function DUF88  30.3 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2805  hypothetical protein  33.12 
 
 		 189 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3836  hypothetical protein  35.51 
 
 		 202 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1943  hypothetical protein  30.05 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.423508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1578  hypothetical protein  39.5 
 
 		 179 aa  75.1  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0544432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0165  protein of unknown function DUF88  33.57 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.334163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2466  hypothetical protein  30.67 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0134  hypothetical protein  31.25 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00589  hypothetical protein  32.88 
 
 		 156 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5380  protein of unknown function DUF88  27.27 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.458157 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0526  hypothetical protein  29.49 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1710  hypothetical protein  32.21 
 
 		 158 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1288  hypothetical protein  30.72 
 
 		 157 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000264072  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0758  hypothetical protein  30.87 
 
 		 158 aa  64.7  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3730  hypothetical protein  31.08 
 
 		 159 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1407  hypothetical protein  28.86 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  28.57 
 
 		 181 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4925  hypothetical protein  31.54 
 
 		 159 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12750  hypothetical protein  31.51 
 
 		 167 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3258  hypothetical protein  31.54 
 
 		 157 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1157  hypothetical protein  32.19 
 
 		 167 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111181  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1362  hypothetical protein  28.93 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0533358  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4769  hypothetical protein  31.54 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40399  hitchhiker  0.00938493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4644  hypothetical protein  31.54 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.54947  normal  0.0402437 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2781  hypothetical protein  26.01 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2873  protein of unknown function DUF88  26.4 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0893  hypothetical protein  28.86 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4782  hypothetical protein  31.54 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0796  protein of unknown function DUF88  29.93 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0652  hypothetical protein  30.87 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00256756  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4301  hypothetical protein  31.54 
 
 		 158 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000509766  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3118  hypothetical protein  30.57 
 
 		 157 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.26612 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0945  hypothetical protein  30.61 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.279417 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3176  hypothetical protein  31.08 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1195  protein of unknown function DUF88  31.08 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3175  hypothetical protein  31.08 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2746  protein of unknown function DUF88  28.77 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0482662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1154  hypothetical protein  29.53 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.215618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3319  hypothetical protein  31.08 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4666  hypothetical protein  31.54 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0663  hypothetical protein  37.5 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6243  hypothetical protein  26.92 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0812  protein of unknown function DUF88  37.5 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>