111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0663 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0812  protein of unknown function DUF88  100 
 
 
318 aa  645    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0663  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  645    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0311  hypothetical protein  55.76 
 
 
274 aa  302  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.968362  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6243  hypothetical protein  45.59 
 
 
272 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1859  hypothetical protein  34.15 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00561567  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2447  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1000  protein of unknown function DUF88  33.54 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4689  hypothetical protein  31.55 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501693  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1440  hypothetical protein  32.3 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0511  hypothetical protein  31.91 
 
 
191 aa  77  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2633  hypothetical protein  30.95 
 
 
208 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0521932  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2257  hypothetical protein  31.55 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1893  hypothetical protein  32.52 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  hitchhiker  0.00176101 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0991  protein of unknown function DUF88  31.06 
 
 
195 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  31.68 
 
 
193 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  31.06 
 
 
193 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2645  hypothetical protein  29.94 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  hitchhiker  0.00814137 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1924  hypothetical protein  30.36 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2606  hypothetical protein  31.06 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0253982  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2966  protein of unknown function DUF88  31.06 
 
 
216 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180481  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3193  hypothetical protein  30.67 
 
 
218 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.951691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3517  protein of unknown function DUF88  30.67 
 
 
218 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0650346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3389  protein of unknown function DUF88  30.67 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3836  hypothetical protein  31.06 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0944  hypothetical protein  29.81 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0294476  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  29.81 
 
 
190 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0035  protein of unknown function DUF88  29.69 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153842  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  29.19 
 
 
190 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  29.19 
 
 
190 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  29.19 
 
 
190 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  29.19 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_009667  Oant_2638  hypothetical protein  29.17 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0033  hypothetical protein  30.67 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_004310  BR0649  hypothetical protein  29.17 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  29.19 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2865  hypothetical protein  35.56 
 
 
206 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414585  normal  0.0571664 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2008  protein of unknown function DUF88  41.18 
 
 
304 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888225  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0528  hypothetical protein  27.67 
 
 
190 aa  62.8  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0275005  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5380  protein of unknown function DUF88  31.45 
 
 
356 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.458157 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0433  protein of unknown function DUF88  39.47 
 
 
294 aa  62.4  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1578  hypothetical protein  29.88 
 
 
179 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0544432  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  34.07 
 
 
194 aa  60.1  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0379  protein of unknown function DUF88  35.56 
 
 
203 aa  60.5  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.31368  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1723  hypothetical protein  34.44 
 
 
207 aa  59.7  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.761661  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2110  hypothetical protein  26.88 
 
 
173 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850864  normal  0.350459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2722  hypothetical protein  29.33 
 
 
209 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353362  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4859  hypothetical protein  29.33 
 
 
210 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0181079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1943  hypothetical protein  26.88 
 
 
236 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.423508  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1143  hypothetical protein  27.21 
 
 
198 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1877  hypothetical protein  28.83 
 
 
194 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000471771  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0945  hypothetical protein  31.4 
 
 
181 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.279417 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0671  hypothetical protein  25.66 
 
 
192 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420654  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  37.5 
 
 
287 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1891  hypothetical protein  26.71 
 
 
186 aa  57  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248989  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1805  hypothetical protein  30 
 
 
204 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000048787 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4322  hypothetical protein  26.88 
 
 
173 aa  57  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3333  protein of unknown function DUF88  27.89 
 
 
207 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.258648  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0673  protein of unknown function DUF88  27.67 
 
 
165 aa  56.2  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.696503  normal  0.0525429 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0796  protein of unknown function DUF88  27.39 
 
 
165 aa  55.8  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4688  protein of unknown function DUF88  30.93 
 
 
172 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.706781  normal  0.898673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2466  hypothetical protein  25.64 
 
 
228 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3991  protein of unknown function DUF88  28 
 
 
226 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4033  protein of unknown function DUF88  28 
 
 
226 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.424874  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3179  protein of unknown function DUF88  31.58 
 
 
165 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.488088  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1654  protein of unknown function DUF88  25.67 
 
 
195 aa  54.3  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0466931  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2746  protein of unknown function DUF88  26.75 
 
 
165 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0482662  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1847  protein of unknown function DUF88  29.9 
 
 
178 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3645  protein of unknown function DUF88  29.9 
 
 
180 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0165  protein of unknown function DUF88  26.35 
 
 
343 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.334163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1873  protein of unknown function DUF88  29.9 
 
 
178 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4322  hypothetical protein  29.9 
 
 
171 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.833366  normal  0.664553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0096  protein of unknown function DUF88  25.85 
 
 
201 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.263134 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0224  protein of unknown function DUF88  34.52 
 
 
165 aa  53.1  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121246  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0482  hypothetical protein  36.84 
 
 
287 aa  52.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0526  hypothetical protein  32.87 
 
 
295 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491668  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2805  hypothetical protein  26.52 
 
 
189 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2303  protein of unknown function DUF88  34.29 
 
 
168 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1195  protein of unknown function DUF88  27.56 
 
 
176 aa  50.8  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1710  hypothetical protein  25.56 
 
 
158 aa  50.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  26.92 
 
 
260 aa  50.1  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00589  hypothetical protein  30.61 
 
 
156 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4769  hypothetical protein  27.14 
 
 
159 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40399  hitchhiker  0.00938493 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0758  hypothetical protein  26.71 
 
 
158 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4644  hypothetical protein  27.14 
 
 
159 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.54947  normal  0.0402437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3176  hypothetical protein  24.69 
 
 
157 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4782  hypothetical protein  27.14 
 
 
159 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3175  hypothetical protein  24.69 
 
 
157 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3319  hypothetical protein  24.69 
 
 
157 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1195  protein of unknown function DUF88  24.69 
 
 
157 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4925  hypothetical protein  23.31 
 
 
159 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2790  hypothetical protein  24.69 
 
 
157 aa  46.6  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0134  hypothetical protein  23.68 
 
 
157 aa  46.2  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1080  hypothetical protein  23.12 
 
 
184 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0372  hypothetical protein  22.5 
 
 
184 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000170684  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  34.04 
 
 
408 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3118  hypothetical protein  24.68 
 
 
157 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.26612 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3258  hypothetical protein  20.62 
 
 
157 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1407  hypothetical protein  24.38 
 
 
157 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0652  hypothetical protein  29.58 
 
 
159 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00256756  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3730  hypothetical protein  31.65 
 
 
159 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>