120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1891 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1891  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  384  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248989  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3645  protein of unknown function DUF88  81.93 
 
 
180 aa  292  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4322  hypothetical protein  79.65 
 
 
171 aa  289  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.833366  normal  0.664553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4688  protein of unknown function DUF88  80.84 
 
 
172 aa  289  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.706781  normal  0.898673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4322  hypothetical protein  80.35 
 
 
173 aa  288  3e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2110  hypothetical protein  81.55 
 
 
173 aa  285  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850864  normal  0.350459 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1873  protein of unknown function DUF88  80.72 
 
 
178 aa  285  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1847  protein of unknown function DUF88  80.72 
 
 
178 aa  285  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  43.92 
 
 
194 aa  144  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2303  protein of unknown function DUF88  43.79 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1877  hypothetical protein  39.18 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000471771  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2865  hypothetical protein  38.95 
 
 
206 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414585  normal  0.0571664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2447  hypothetical protein  38.66 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1723  hypothetical protein  38.89 
 
 
207 aa  111  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.761661  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2633  hypothetical protein  37.3 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0521932  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0528  hypothetical protein  37.08 
 
 
190 aa  108  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0275005  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1440  hypothetical protein  39.47 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  40 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1000  protein of unknown function DUF88  39.33 
 
 
205 aa  108  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4689  hypothetical protein  36.22 
 
 
217 aa  107  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501693  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1859  hypothetical protein  39.11 
 
 
214 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00561567  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2257  hypothetical protein  36.84 
 
 
206 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2645  hypothetical protein  36.67 
 
 
228 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  hitchhiker  0.00814137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  39.25 
 
 
193 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1143  hypothetical protein  35.56 
 
 
198 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2606  hypothetical protein  37.22 
 
 
209 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0253982  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1805  hypothetical protein  35.56 
 
 
204 aa  105  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000048787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3836  hypothetical protein  39.77 
 
 
202 aa  104  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1924  hypothetical protein  35.5 
 
 
205 aa  103  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4859  hypothetical protein  38.46 
 
 
210 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0181079  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2008  protein of unknown function DUF88  37.5 
 
 
304 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888225  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2966  protein of unknown function DUF88  38.46 
 
 
216 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180481  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0991  protein of unknown function DUF88  37.77 
 
 
195 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2722  hypothetical protein  38.46 
 
 
209 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353362  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  37.7 
 
 
190 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  37.7 
 
 
190 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3333  protein of unknown function DUF88  38.46 
 
 
207 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.258648  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  37.17 
 
 
190 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4033  protein of unknown function DUF88  37.06 
 
 
226 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.424874  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3991  protein of unknown function DUF88  37.06 
 
 
226 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2638  hypothetical protein  37.91 
 
 
191 aa  101  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0649  hypothetical protein  37.36 
 
 
191 aa  100  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0944  hypothetical protein  37.85 
 
 
194 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0294476  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1893  hypothetical protein  37.29 
 
 
213 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  hitchhiker  0.00176101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3193  hypothetical protein  38.01 
 
 
218 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.951691 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0379  protein of unknown function DUF88  33.5 
 
 
203 aa  99.4  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.31368  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3517  protein of unknown function DUF88  38.01 
 
 
218 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0650346 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2873  protein of unknown function DUF88  37.95 
 
 
213 aa  99.4  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0096  protein of unknown function DUF88  35.67 
 
 
201 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.263134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3389  protein of unknown function DUF88  37.85 
 
 
217 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0511  hypothetical protein  38.29 
 
 
191 aa  97.8  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  36.11 
 
 
183 aa  97.8  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2781  hypothetical protein  34.13 
 
 
190 aa  97.4  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130399  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  35.75 
 
 
189 aa  97.1  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  33.53 
 
 
287 aa  95.5  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  35.43 
 
 
190 aa  92.8  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0035  protein of unknown function DUF88  36.02 
 
 
219 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153842  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0433  protein of unknown function DUF88  34.94 
 
 
294 aa  90.9  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0482  hypothetical protein  30.81 
 
 
287 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1578  hypothetical protein  35.75 
 
 
179 aa  89  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0544432  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0033  hypothetical protein  37.04 
 
 
216 aa  89  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1195  protein of unknown function DUF88  33.73 
 
 
176 aa  88.2  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2466  hypothetical protein  32.12 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1943  hypothetical protein  31.61 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.423508  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2746  protein of unknown function DUF88  28.9 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0482662  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1710  hypothetical protein  30.06 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0165  protein of unknown function DUF88  30.82 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.334163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3730  hypothetical protein  30.52 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4301  hypothetical protein  32.26 
 
 
158 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000509766  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5380  protein of unknown function DUF88  30.82 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.458157 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0945  hypothetical protein  30.11 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.279417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1362  hypothetical protein  29.19 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0533358  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1028  hypothetical protein  28.93 
 
 
157 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.873196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12750  hypothetical protein  31.06 
 
 
167 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019537  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0796  protein of unknown function DUF88  26.59 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1261  hypothetical protein  29.45 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0151498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4666  hypothetical protein  30.97 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1157  hypothetical protein  29.94 
 
 
167 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111181  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3176  hypothetical protein  28.85 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3175  hypothetical protein  28.85 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3319  hypothetical protein  28.85 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1195  protein of unknown function DUF88  28.85 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3258  hypothetical protein  33.83 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2790  hypothetical protein  28.85 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4925  hypothetical protein  29.56 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0758  hypothetical protein  32.48 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2805  hypothetical protein  29.76 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0652  hypothetical protein  31.68 
 
 
159 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00256756  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00589  hypothetical protein  27.92 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4769  hypothetical protein  29.56 
 
 
159 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40399  hitchhiker  0.00938493 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3118  hypothetical protein  28.66 
 
 
157 aa  62.8  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.26612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4644  hypothetical protein  29.56 
 
 
159 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.54947  normal  0.0402437 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4782  hypothetical protein  29.56 
 
 
159 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  26.92 
 
 
195 aa  62  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0673  protein of unknown function DUF88  27.56 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.696503  normal  0.0525429 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3490  hypothetical protein  27.44 
 
 
157 aa  60.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0372  hypothetical protein  27.04 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000170684  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1148  hypothetical protein  27.33 
 
 
157 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.882158  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0224  protein of unknown function DUF88  28.57 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121246  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1407  hypothetical protein  28.57 
 
 
157 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>