128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1578 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1578  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  359  1e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0544432  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1723  hypothetical protein  63.48 
 
 
207 aa  251  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.761661  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  64.37 
 
 
189 aa  247  8e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_007643  Rru_A1859  hypothetical protein  63.07 
 
 
214 aa  246  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00561567  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2865  hypothetical protein  63.43 
 
 
206 aa  244  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414585  normal  0.0571664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  62.64 
 
 
190 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  62.64 
 
 
190 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  62.64 
 
 
190 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  63.16 
 
 
190 aa  239  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0511  hypothetical protein  61.99 
 
 
191 aa  238  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  60.92 
 
 
183 aa  235  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2447  hypothetical protein  63.69 
 
 
203 aa  233  9e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1000  protein of unknown function DUF88  64.29 
 
 
205 aa  233  9e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  59.32 
 
 
193 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3836  hypothetical protein  61.4 
 
 
202 aa  230  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3389  protein of unknown function DUF88  60.82 
 
 
217 aa  230  8.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1440  hypothetical protein  58.86 
 
 
192 aa  229  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3193  hypothetical protein  60.82 
 
 
218 aa  229  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.951691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3517  protein of unknown function DUF88  60.82 
 
 
218 aa  229  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0650346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0991  protein of unknown function DUF88  58.29 
 
 
195 aa  228  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  57.71 
 
 
193 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1893  hypothetical protein  57.31 
 
 
213 aa  223  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  hitchhiker  0.00176101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0033  hypothetical protein  59.52 
 
 
216 aa  223  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2966  protein of unknown function DUF88  54.8 
 
 
216 aa  221  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180481  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2645  hypothetical protein  55.37 
 
 
228 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  hitchhiker  0.00814137 
 
 
-
 
NC_004310  BR0649  hypothetical protein  57.89 
 
 
191 aa  220  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2606  hypothetical protein  55.37 
 
 
209 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0253982  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2633  hypothetical protein  55.88 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0521932  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2257  hypothetical protein  56.47 
 
 
206 aa  219  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2638  hypothetical protein  58.48 
 
 
191 aa  220  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0035  protein of unknown function DUF88  57.74 
 
 
219 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153842  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1924  hypothetical protein  56.47 
 
 
205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0944  hypothetical protein  54.86 
 
 
194 aa  217  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0294476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4689  hypothetical protein  55.29 
 
 
217 aa  217  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501693  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0528  hypothetical protein  57.74 
 
 
190 aa  215  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0275005  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0379  protein of unknown function DUF88  54.19 
 
 
203 aa  213  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.31368  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1877  hypothetical protein  53.01 
 
 
194 aa  204  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000471771  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  39.08 
 
 
194 aa  117  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3645  protein of unknown function DUF88  37.08 
 
 
180 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4322  hypothetical protein  38.24 
 
 
171 aa  105  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.833366  normal  0.664553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1873  protein of unknown function DUF88  36.93 
 
 
178 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1847  protein of unknown function DUF88  36.93 
 
 
178 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2110  hypothetical protein  36.72 
 
 
173 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850864  normal  0.350459 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4322  hypothetical protein  36.78 
 
 
173 aa  101  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1143  hypothetical protein  36.09 
 
 
198 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3333  protein of unknown function DUF88  36.05 
 
 
207 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.258648  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1891  hypothetical protein  35.75 
 
 
186 aa  99  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248989  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4688  protein of unknown function DUF88  36.47 
 
 
172 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.706781  normal  0.898673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1943  hypothetical protein  35.43 
 
 
236 aa  97.1  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.423508  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4033  protein of unknown function DUF88  35.5 
 
 
226 aa  94.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.424874  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3991  protein of unknown function DUF88  35.5 
 
 
226 aa  94.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2466  hypothetical protein  32.93 
 
 
228 aa  94  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0096  protein of unknown function DUF88  34.73 
 
 
201 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.263134 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4859  hypothetical protein  33.72 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0181079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2722  hypothetical protein  33.72 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353362  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2008  protein of unknown function DUF88  37.5 
 
 
304 aa  91.7  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888225  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1805  hypothetical protein  31.87 
 
 
204 aa  91.3  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000048787 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2303  protein of unknown function DUF88  34.3 
 
 
168 aa  90.9  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0433  protein of unknown function DUF88  35.92 
 
 
294 aa  86.7  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0482  hypothetical protein  37.86 
 
 
287 aa  81.6  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  38.41 
 
 
287 aa  81.3  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1195  protein of unknown function DUF88  34.86 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5380  protein of unknown function DUF88  29.88 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.458157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2805  hypothetical protein  31.93 
 
 
189 aa  72  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  32.16 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1710  hypothetical protein  26.42 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0812  protein of unknown function DUF88  29.88 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0663  hypothetical protein  29.88 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0526  hypothetical protein  27.71 
 
 
295 aa  68.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491668  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2873  protein of unknown function DUF88  28.4 
 
 
213 aa  67.8  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0796  protein of unknown function DUF88  29.09 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2746  protein of unknown function DUF88  29.34 
 
 
165 aa  67.4  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0482662  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0671  hypothetical protein  28.49 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420654  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1654  protein of unknown function DUF88  28.24 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0466931  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0165  protein of unknown function DUF88  30.18 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.334163 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3118  hypothetical protein  28.4 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.26612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1080  hypothetical protein  28.75 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1080  hypothetical protein  28.05 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1148  hypothetical protein  28.75 
 
 
157 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.882158  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0311  hypothetical protein  28.05 
 
 
274 aa  63.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.968362  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2790  hypothetical protein  27.78 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0673  protein of unknown function DUF88  27.38 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.696503  normal  0.0525429 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0134  hypothetical protein  30.67 
 
 
157 aa  62.8  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1362  hypothetical protein  27.16 
 
 
157 aa  62.4  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0533358  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2781  hypothetical protein  25.75 
 
 
190 aa  62  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130399  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3176  hypothetical protein  27.78 
 
 
157 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1154  hypothetical protein  27.33 
 
 
157 aa  62  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.215618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1261  hypothetical protein  27.16 
 
 
159 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0151498 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3175  hypothetical protein  27.95 
 
 
157 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3319  hypothetical protein  27.95 
 
 
157 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1195  protein of unknown function DUF88  27.95 
 
 
157 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0372  hypothetical protein  27.33 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000170684  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3258  hypothetical protein  31.36 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0945  hypothetical protein  26.99 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.279417 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0224  protein of unknown function DUF88  30 
 
 
165 aa  58.9  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121246  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3490  hypothetical protein  26.38 
 
 
157 aa  58.2  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1157  hypothetical protein  27.61 
 
 
167 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111181  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6243  hypothetical protein  34.41 
 
 
272 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  28.14 
 
 
181 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12750  hypothetical protein  26.99 
 
 
167 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019537  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>