18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2568 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2568  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  394  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  30.09 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_287  hypothetical protein  28.95 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000717319  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  28.7 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  33.59 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  29.46 
 
 		 305 aa  50.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  23.4 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0543  hypothetical protein  53.19 
 
 		 180 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0589546  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3445  protein of unknown function DUF88  37.84 
 
 		 338 aa  48.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2003  hypothetical protein  31.2 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212365  normal  0.0101552 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0443  hypothetical protein  43.75 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220081  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1985  cold shock protein  32.63 
 
 		 310 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4244  protein of unknown function DUF88  30.56 
 
 		 299 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1300  protein of unknown function DUF88  40.62 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000638541  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4306  protein of unknown function DUF88  30.56 
 
 		 299 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.122513 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5380  protein of unknown function DUF88  32.61 
 
 		 356 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.458157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1151  hypothetical protein  42.86 
 
 		 388 aa  42  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.111113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4264  protein of unknown function DUF88  44.44 
 
 		 261 aa  42  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.110451 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>