21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3445 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3445  protein of unknown function DUF88  100 
 
 		 338 aa  698    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1985  cold shock protein  59.82 
 
 		 310 aa  395  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4306  protein of unknown function DUF88  56.85 
 
 		 299 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.122513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4244  protein of unknown function DUF88  56.85 
 
 		 299 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.64 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4302  protein of unknown function DUF88  35.96 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1300  protein of unknown function DUF88  30.14 
 
 		 208 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000638541  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2568  hypothetical protein  42.62 
 
 		 199 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0526  hypothetical protein  31.16 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  32.89 
 
 		 487 aa  47  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46078  predicted protein  40.3 
 
 		 1240 aa  46.6  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.758691  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  44.62 
 
 		 190 aa  46.2  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0449  hypothetical protein  36.76 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.924551  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  41.54 
 
 		 190 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  41.54 
 
 		 190 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  41.54 
 
 		 190 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0857  protein of unknown function DUF88  41.3 
 
 		 275 aa  43.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0543  hypothetical protein  25.93 
 
 		 180 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0589546  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  41.54 
 
 		 189 aa  42.7  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_013174  Jden_1151  hypothetical protein  30.3 
 
 		 388 aa  42.7  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.111113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0511  hypothetical protein  38.46 
 
 		 191 aa  42.7  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>