20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1733 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1733  protein of unknown function DUF88  100 
 
 		 209 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.131677  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2514  hypothetical protein  35.03 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0312456  normal  0.44225 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2008  protein of unknown function DUF88  22.1 
 
 		 304 aa  52  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888225  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  36.11 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_287  hypothetical protein  36.11 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000717319  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  36.11 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  25.91 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  23.71 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0482  hypothetical protein  25.57 
 
 		 287 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3333  protein of unknown function DUF88  24.24 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.258648  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2466  hypothetical protein  27.51 
 
 		 228 aa  45.1  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  25 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0311  hypothetical protein  27.27 
 
 		 274 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.968362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0096  protein of unknown function DUF88  25.56 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.263134 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0945  hypothetical protein  37.04 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.279417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1943  hypothetical protein  25.89 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.423508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1911  protein of unknown function DUF88  30.5 
 
 		 484 aa  42.4  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0671  hypothetical protein  30.67 
 
 		 192 aa  42  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4033  protein of unknown function DUF88  23.71 
 
 		 226 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.424874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3991  protein of unknown function DUF88  23.71 
 
 		 226 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>