180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3445 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  64.92 
 
 		 787 aa  895    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  100 
 
 		 842 aa  1696    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  67.8 
 
 		 600 aa  450  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  54.24 
 
 		 789 aa  406  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  33.88 
 
 		 408 aa  155  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  33.33 
 
 		 487 aa  150  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  31.79 
 
 		 381 aa  125  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  32.15 
 
 		 508 aa  125  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  35.54 
 
 		 480 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  31.67 
 
 		 478 aa  122  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  35.54 
 
 		 440 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  35.54 
 
 		 564 aa  121  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  31.01 
 
 		 507 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  31.01 
 
 		 501 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  36.09 
 
 		 483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  36.09 
 
 		 483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  35 
 
 		 421 aa  119  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  35.59 
 
 		 498 aa  119  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  35.59 
 
 		 498 aa  119  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  35.59 
 
 		 498 aa  119  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  35.59 
 
 		 496 aa  118  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  35.03 
 
 		 472 aa  118  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  36.88 
 
 		 477 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  33.33 
 
 		 260 aa  117  7.999999999999999e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  37.35 
 
 		 308 aa  117  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  35.58 
 
 		 412 aa  110  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  34.38 
 
 		 275 aa  104  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  36.13 
 
 		 253 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  31.53 
 
 		 253 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  31.53 
 
 		 253 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  33.05 
 
 		 249 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  37.74 
 
 		 470 aa  99.4  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  32.34 
 
 		 264 aa  98.6  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  34.72 
 
 		 378 aa  94  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18070  Protein of unknown function DUF88  29.33 
 
 		 335 aa  84  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.304133  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4443  hypothetical protein  29.44 
 
 		 329 aa  83.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1014  hypothetical protein  28.35 
 
 		 299 aa  80.1  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  27.33 
 
 		 268 aa  79.3  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  27.73 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0898  hypothetical protein  27.73 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0915  hypothetical protein  27.73 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  28.32 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0207  hypothetical protein  31.01 
 
 		 194 aa  72.8  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00903203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0855  hypothetical protein  31.21 
 
 		 183 aa  72.4  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000154365  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  32.52 
 
 		 371 aa  69.7  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1878  protein of unknown function DUF88  28.67 
 
 		 320 aa  66.6  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.176137  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5405  protein of unknown function DUF88  27.85 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.964746  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  28.33 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  31.47 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3082  hypothetical protein  26.21 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  29.72 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3452  hypothetical protein  28.07 
 
 		 282 aa  63.9  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1934  protein of unknown function DUF88  29.38 
 
 		 552 aa  62.8  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000288494  normal  0.0274849 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  27.68 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0532  protein of unknown function DUF88  28.67 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  25.87 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1404  protein of unknown function DUF88  28.89 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.516072  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  58.9  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  28.45 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  31.68 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  27.65 
 
 		 419 aa  57.4  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0520  hypothetical protein  28.99 
 
 		 262 aa  57.4  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  30.18 
 
 		 246 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  28.57 
 
 		 234 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  29.11 
 
 		 251 aa  55.8  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  29.1 
 
 		 258 aa  56.2  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  29.75 
 
 		 286 aa  55.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  28.57 
 
 		 234 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  27.06 
 
 		 232 aa  56.2  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  31.45 
 
 		 249 aa  55.1  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  30.14 
 
 		 284 aa  55.5  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  28.78 
 
 		 335 aa  55.1  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0221  hypothetical protein  25.71 
 
 		 193 aa  55.1  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  26.47 
 
 		 232 aa  54.7  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  30 
 
 		 260 aa  54.7  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  26.47 
 
 		 232 aa  54.3  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2484  hypothetical protein  23.72 
 
 		 439 aa  53.9  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00113577  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2469  protein of unknown function DUF88  26.58 
 
 		 629 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1608  hypothetical protein  21.83 
 
 		 215 aa  53.9  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.675202  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0373  hypothetical protein  21.66 
 
 		 215 aa  54.3  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2008  protein of unknown function DUF88  29.41 
 
 		 304 aa  53.1  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0095  hypothetical protein  26.48 
 
 		 273 aa  52.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0117028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  25.71 
 
 		 190 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  28.9 
 
 		 239 aa  52.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  27.81 
 
 		 432 aa  52.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3025  protein of unknown function DUF88  28.05 
 
 		 285 aa  52.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.775317  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  30.99 
 
 		 276 aa  52.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4318  hypothetical protein  29.29 
 
 		 298 aa  52.8  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.577985  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  25.71 
 
 		 190 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  29.94 
 
 		 265 aa  52.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0543  hypothetical protein  23.23 
 
 		 193 aa  52.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  29.21 
 
 		 253 aa  52.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  25.71 
 
 		 193 aa  52.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0304  hypothetical protein  23.23 
 
 		 215 aa  52.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  26.67 
 
 		 229 aa  52.4  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  30.46 
 
 		 248 aa  52  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  27.33 
 
 		 183 aa  52  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  30.46 
 
 		 248 aa  52  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  25.71 
 
 		 190 aa  52.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0316  hypothetical protein  28.83 
 
 		 264 aa  52  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>