201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1798 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  99.79 
 
 
483 aa  967    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  83.92 
 
 
472 aa  711    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  98.32 
 
 
477 aa  863    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  100 
 
 
483 aa  968    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  58.85 
 
 
498 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  58.85 
 
 
498 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  72.22 
 
 
498 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  85.41 
 
 
496 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  85 
 
 
508 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  57.56 
 
 
507 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  55.66 
 
 
501 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  55.25 
 
 
480 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  78.01 
 
 
564 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  80.07 
 
 
440 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  73.27 
 
 
381 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  53.88 
 
 
421 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  66.06 
 
 
275 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  51.84 
 
 
308 aa  312  9e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  59.85 
 
 
264 aa  304  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  43.84 
 
 
260 aa  216  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  42.29 
 
 
253 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  42.29 
 
 
253 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  42.63 
 
 
253 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  39.55 
 
 
249 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  38.08 
 
 
378 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  48.99 
 
 
412 aa  155  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  49.66 
 
 
470 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  35.03 
 
 
787 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  35.03 
 
 
842 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  31.82 
 
 
789 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  33.94 
 
 
600 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  26.5 
 
 
272 aa  103  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  31.71 
 
 
268 aa  101  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  28.21 
 
 
311 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0898  hypothetical protein  28.21 
 
 
311 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0915  hypothetical protein  28.21 
 
 
311 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281794  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  27.13 
 
 
258 aa  98.2  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  29.22 
 
 
249 aa  97.1  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  28.79 
 
 
319 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  32.65 
 
 
272 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4443  hypothetical protein  25.18 
 
 
329 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  29.06 
 
 
408 aa  91.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  27.44 
 
 
487 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1934  protein of unknown function DUF88  28.86 
 
 
552 aa  90.9  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000288494  normal  0.0274849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  28.89 
 
 
258 aa  90.5  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  33.33 
 
 
371 aa  90.1  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  27.84 
 
 
234 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  27.84 
 
 
234 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1014  hypothetical protein  26.01 
 
 
299 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  29.31 
 
 
259 aa  89.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  36.92 
 
 
275 aa  88.2  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  30.17 
 
 
264 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  27.2 
 
 
419 aa  87.8  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  29.11 
 
 
259 aa  87.8  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0028  protein of unknown function DUF88  31.1 
 
 
509 aa  86.7  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  30.04 
 
 
286 aa  86.7  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18070  Protein of unknown function DUF88  24.92 
 
 
335 aa  86.3  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.304133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  28.51 
 
 
253 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  30.6 
 
 
260 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  31 
 
 
249 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  28.51 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0344  protein of unknown function DUF88  30.95 
 
 
504 aa  85.1  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.752457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  29.12 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  28.68 
 
 
432 aa  84.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0056  protein of unknown function DUF88  31.1 
 
 
448 aa  84.7  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  28.77 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  31.13 
 
 
240 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1706  hypothetical protein  30 
 
 
507 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.936741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2469  protein of unknown function DUF88  34.9 
 
 
629 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3848  hypothetical protein  32.32 
 
 
461 aa  82.4  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  32.89 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  31.36 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  27.9 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  31.82 
 
 
432 aa  80.5  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  28.95 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0587  protein of unknown function DUF88  30 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000787089  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  41.32 
 
 
251 aa  79  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  30.59 
 
 
249 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000370224  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  31.67 
 
 
252 aa  78.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  35.94 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  27.87 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1289  protein of unknown function DUF88  33.57 
 
 
474 aa  78.2  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  hitchhiker  0.00441203 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  27.87 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  35.2 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  35.43 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  27.87 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  30.61 
 
 
247 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1187  hypothetical protein  31.29 
 
 
418 aa  77  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000236385  decreased coverage  0.000174597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0857  protein of unknown function DUF88  36.3 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11160  conserved hypothetical protein  26.69 
 
 
262 aa  76.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997063  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  30.37 
 
 
247 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  34.92 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11150  hypothetical protein  30.92 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.280093 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2484  hypothetical protein  31.94 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00113577  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  27.35 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3051  protein of unknown function DUF88  31.29 
 
 
418 aa  73.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3452  hypothetical protein  32.56 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6293  protein of unknown function DUF88  25.96 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  31.52 
 
 
229 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  27.06 
 
 
248 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.151004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>