17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2748 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2748  protein of unknown function DUF88  100 
 
 
148 aa  291  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1242  protein of unknown function DUF88  70.37 
 
 
164 aa  187  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2050  protein of unknown function DUF88  68.94 
 
 
156 aa  175  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1879  protein of unknown function DUF88  63.58 
 
 
152 aa  170  7.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.201136 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0713  protein of unknown function DUF88  70.59 
 
 
154 aa  167  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0855  hypothetical protein  41.73 
 
 
183 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000154365  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0207  hypothetical protein  43.65 
 
 
194 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00903203  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0373  hypothetical protein  41.41 
 
 
215 aa  103  6e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1608  hypothetical protein  40.62 
 
 
215 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.675202  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0304  hypothetical protein  40.62 
 
 
215 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0221  hypothetical protein  38.46 
 
 
193 aa  102  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0543  hypothetical protein  41.27 
 
 
193 aa  102  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1300  hypothetical protein  37.86 
 
 
162 aa  101  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0511  hypothetical protein  27.14 
 
 
191 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2275  protein of unknown function DUF88  40.43 
 
 
188 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0433  protein of unknown function DUF88  26.47 
 
 
294 aa  40.8  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2008  protein of unknown function DUF88  24.63 
 
 
304 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>