38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1300 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1300  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  330  6e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0855  hypothetical protein  73.33 
 
 		 183 aa  248  4e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000154365  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0207  hypothetical protein  72.67 
 
 		 194 aa  238  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00903203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0373  hypothetical protein  54.97 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0221  hypothetical protein  56.74 
 
 		 193 aa  177  7e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0304  hypothetical protein  55.17 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1608  hypothetical protein  55.17 
 
 		 215 aa  175  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.675202  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0543  hypothetical protein  58.91 
 
 		 193 aa  169  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2050  protein of unknown function DUF88  40.41 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1879  protein of unknown function DUF88  37.41 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.201136 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2748  protein of unknown function DUF88  37.86 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0713  protein of unknown function DUF88  39.74 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1242  protein of unknown function DUF88  35.81 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  29.05 
 
 		 249 aa  51.2  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  25.34 
 
 		 268 aa  50.8  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  26.77 
 
 		 242 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  24.66 
 
 		 268 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  22.73 
 
 		 600 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  39.13 
 
 		 487 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  25.81 
 
 		 259 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  23.94 
 
 		 265 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  25.58 
 
 		 842 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  25.81 
 
 		 276 aa  45.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  24.83 
 
 		 334 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  20.41 
 
 		 275 aa  45.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  25.58 
 
 		 787 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  27.46 
 
 		 371 aa  43.9  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  27.21 
 
 		 432 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  24.82 
 
 		 335 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  35.29 
 
 		 408 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4318  hypothetical protein  27.56 
 
 		 298 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.577985  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  24.17 
 
 		 284 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  23.62 
 
 		 260 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3025  protein of unknown function DUF88  27.87 
 
 		 285 aa  41.2  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.775317  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  24.09 
 
 		 279 aa  41.2  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  25.69 
 
 		 236 aa  40.8  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  22.13 
 
 		 272 aa  40.8  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3744  hypothetical protein  27.05 
 
 		 287 aa  40.4  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>