153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04690 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  833    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  57.6 
 
 
378 aa  393  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  50.32 
 
 
470 aa  392  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  35.42 
 
 
483 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  35.42 
 
 
483 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  35.42 
 
 
477 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  35.11 
 
 
472 aa  176  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  35.42 
 
 
478 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  33.86 
 
 
508 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  33.23 
 
 
507 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  33.23 
 
 
501 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  34.8 
 
 
480 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  34.25 
 
 
275 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  33.64 
 
 
308 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  32.92 
 
 
496 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  34.17 
 
 
498 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  34.17 
 
 
498 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  34.17 
 
 
498 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  47.65 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  47.02 
 
 
249 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  47.65 
 
 
564 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  46.98 
 
 
421 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  47.65 
 
 
440 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  48.65 
 
 
253 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  48.65 
 
 
253 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  48.65 
 
 
253 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  46.25 
 
 
264 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  47.1 
 
 
260 aa  141  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  35.58 
 
 
842 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  34.97 
 
 
600 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  35.58 
 
 
787 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4443  hypothetical protein  28.37 
 
 
329 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  36.75 
 
 
789 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  36.9 
 
 
272 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  35.15 
 
 
268 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18070  Protein of unknown function DUF88  27.35 
 
 
335 aa  98.2  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.304133  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1014  hypothetical protein  32.6 
 
 
299 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  24.58 
 
 
311 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0898  hypothetical protein  24.58 
 
 
311 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0915  hypothetical protein  24.58 
 
 
311 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281794  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  37.28 
 
 
319 aa  86.7  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  34.88 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2469  protein of unknown function DUF88  27.36 
 
 
629 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  30.27 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  30.92 
 
 
232 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  30.92 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  30.92 
 
 
432 aa  77.8  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5405  protein of unknown function DUF88  30.9 
 
 
450 aa  77  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.964746  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  32.9 
 
 
286 aa  77  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1934  protein of unknown function DUF88  30.65 
 
 
552 aa  76.6  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000288494  normal  0.0274849 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  30.26 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  31.48 
 
 
487 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  32.89 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  30.46 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  26.97 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3452  hypothetical protein  31.82 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  29.68 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  30.92 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  26.28 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  32.28 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  25.48 
 
 
334 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1706  hypothetical protein  29.37 
 
 
507 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.936741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  27.27 
 
 
259 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  26.56 
 
 
253 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11150  hypothetical protein  31.25 
 
 
314 aa  65.1  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.280093 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  32 
 
 
249 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  30.92 
 
 
276 aa  64.3  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  31.13 
 
 
265 aa  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1386  hypothetical protein  31.68 
 
 
303 aa  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  32.45 
 
 
260 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0316  hypothetical protein  29.41 
 
 
264 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  27.56 
 
 
275 aa  63.2  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  29.68 
 
 
268 aa  62.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6293  protein of unknown function DUF88  29.51 
 
 
262 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  31.4 
 
 
432 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3744  hypothetical protein  31.82 
 
 
287 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3025  protein of unknown function DUF88  31.17 
 
 
285 aa  62  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.775317  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  32.23 
 
 
247 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  23.08 
 
 
234 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  28.76 
 
 
252 aa  61.2  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  28.76 
 
 
268 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4318  hypothetical protein  29.87 
 
 
298 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.577985  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  23.08 
 
 
234 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  27.74 
 
 
242 aa  60.8  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  26.86 
 
 
246 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  28.99 
 
 
248 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0520  hypothetical protein  25.81 
 
 
262 aa  60.5  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  27.27 
 
 
249 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000370224  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  28.81 
 
 
240 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  28.99 
 
 
248 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  29.49 
 
 
259 aa  60.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2536  hypothetical protein  26.11 
 
 
313 aa  60.1  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13473  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  32.26 
 
 
247 aa  59.7  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  31.15 
 
 
236 aa  59.7  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05410  Protein of unknown function DUF88  29.31 
 
 
312 aa  59.3  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000245308  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3564  hypothetical protein  32.14 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0028  protein of unknown function DUF88  28.66 
 
 
509 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0344  protein of unknown function DUF88  29.17 
 
 
504 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.752457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  32.5 
 
 
260 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  28.29 
 
 
272 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>