191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0775 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  980    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  87.71 
 
 		 478 aa  786    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  62.91 
 
 		 440 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  78.72 
 
 		 564 aa  487  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  77.85 
 
 		 381 aa  482  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  54.16 
 
 		 483 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  53.97 
 
 		 483 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  52.04 
 
 		 507 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  78.45 
 
 		 496 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  69.32 
 
 		 498 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  69.32 
 
 		 498 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  78.7 
 
 		 498 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  60 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  70.87 
 
 		 508 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  77.17 
 
 		 472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  78.65 
 
 		 477 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  68.6 
 
 		 421 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  63.5 
 
 		 275 aa  359  8e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  54.3 
 
 		 308 aa  317  4e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  57.93 
 
 		 264 aa  303  6.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  41.39 
 
 		 260 aa  213  7e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  37.45 
 
 		 253 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  37.59 
 
 		 253 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  38.11 
 
 		 253 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  37.97 
 
 		 249 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  36.39 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  46.54 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  48.32 
 
 		 470 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  32.84 
 
 		 787 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  35.54 
 
 		 842 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  34.16 
 
 		 789 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  27.47 
 
 		 272 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  33.12 
 
 		 600 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1934  protein of unknown function DUF88  27.59 
 
 		 552 aa  103  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000288494  normal  0.0274849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0898  hypothetical protein  28.57 
 
 		 311 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0915  hypothetical protein  28.57 
 
 		 311 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  32.93 
 
 		 268 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  28.57 
 
 		 311 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18070  Protein of unknown function DUF88  25.4 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.304133  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  27.55 
 
 		 258 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  29.76 
 
 		 275 aa  95.9  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4443  hypothetical protein  27.34 
 
 		 329 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1014  hypothetical protein  25.98 
 
 		 299 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  31.13 
 
 		 249 aa  92  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  30.65 
 
 		 272 aa  90.9  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  26.17 
 
 		 259 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  27.17 
 
 		 487 aa  87  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  28.91 
 
 		 319 aa  86.7  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  27.07 
 
 		 258 aa  86.7  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  36.6 
 
 		 232 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  28.57 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  27.27 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  27.74 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  36.6 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0028  protein of unknown function DUF88  29.8 
 
 		 509 aa  84.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  30.91 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  36.67 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  25.87 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  25.87 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  27.64 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  28.68 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0056  protein of unknown function DUF88  26.55 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  27.94 
 
 		 268 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  30.84 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  28.46 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1706  hypothetical protein  28.79 
 
 		 507 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.936741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  36.59 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0344  protein of unknown function DUF88  29.94 
 
 		 504 aa  79.7  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.752457  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  28.69 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  25.59 
 
 		 246 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  27.27 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  29.63 
 
 		 240 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.234327 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11160  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  28.05 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  28.76 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  31.79 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  34.27 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  30.09 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0095  hypothetical protein  27.31 
 
 		 273 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0117028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  35.71 
 
 		 260 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  27.2 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1289  protein of unknown function DUF88  33.08 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  hitchhiker  0.00441203 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  33.56 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3848  hypothetical protein  29.71 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11150  hypothetical protein  32.68 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.280093 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0587  protein of unknown function DUF88  27.7 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000787089  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  27.88 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000370224  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2484  hypothetical protein  30.67 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00113577  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  33.61 
 
 		 242 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1187  hypothetical protein  28.67 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000236385  decreased coverage  0.000174597 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  26.32 
 
 		 276 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  30 
 
 		 262 aa  72  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4482  hypothetical protein  24.62 
 
 		 267 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  27.36 
 
 		 247 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2469  protein of unknown function DUF88  32.43 
 
 		 629 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  27.96 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  27.56 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  26.94 
 
 		 236 aa  72  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  28.5 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0857  protein of unknown function DUF88  42.2 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>