135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2090 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  555  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  73.09 
 
 
272 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  31.4 
 
 
311 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0898  hypothetical protein  31.4 
 
 
311 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0915  hypothetical protein  31.4 
 
 
311 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281794  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1014  hypothetical protein  32.18 
 
 
299 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4443  hypothetical protein  31.44 
 
 
329 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18070  Protein of unknown function DUF88  38.34 
 
 
335 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.304133  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  30.99 
 
 
260 aa  122  5e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  27.86 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  31.35 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  30.2 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  29.92 
 
 
478 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  29.3 
 
 
496 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  30.23 
 
 
480 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  30.04 
 
 
564 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  29.46 
 
 
275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  32.54 
 
 
501 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  33.14 
 
 
507 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  33.14 
 
 
508 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  31.95 
 
 
498 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  31.95 
 
 
498 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  31.95 
 
 
498 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  31.28 
 
 
440 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  29.64 
 
 
472 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  31.95 
 
 
483 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  31.95 
 
 
483 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  32.14 
 
 
477 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  29.18 
 
 
253 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  29.18 
 
 
253 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  30.46 
 
 
421 aa  105  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  30.12 
 
 
253 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  27.82 
 
 
249 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  33.7 
 
 
412 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  40.94 
 
 
470 aa  92  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  38.3 
 
 
378 aa  89.4  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  29.12 
 
 
600 aa  88.6  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  28.09 
 
 
787 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  27.53 
 
 
842 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  27.43 
 
 
789 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  26.67 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  25.45 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  28.05 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  26.61 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  24.77 
 
 
258 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  23.64 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3452  hypothetical protein  34.01 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  27.43 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  26.67 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4482  hypothetical protein  29.84 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2536  hypothetical protein  25.11 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13473  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  25.6 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000370224  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  24.53 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  27.11 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  27.23 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  25.51 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5405  protein of unknown function DUF88  25.63 
 
 
450 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.964746  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  26.07 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  26.82 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  25.96 
 
 
432 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6293  protein of unknown function DUF88  25.88 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  23.91 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  25.1 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  25.51 
 
 
487 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  22.38 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  24.29 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4745  hypothetical protein  30.5 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  26.53 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  24.64 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  22.38 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0316  hypothetical protein  27.1 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  26.44 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3025  protein of unknown function DUF88  26.91 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.775317  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  23.5 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1180  hypothetical protein  37.4 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  24.44 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  26.67 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0095  hypothetical protein  25.43 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0117028  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  27.08 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  26.25 
 
 
268 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4005  hypothetical protein  27.46 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  26.24 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0520  hypothetical protein  21.99 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  28.07 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  27.8 
 
 
248 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  27.8 
 
 
248 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3744  hypothetical protein  25.1 
 
 
287 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  28.87 
 
 
432 aa  62.8  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11160  conserved hypothetical protein  25.12 
 
 
262 aa  62.4  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997063  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  31.01 
 
 
371 aa  62.4  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  29.38 
 
 
408 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  24.67 
 
 
260 aa  62  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05410  Protein of unknown function DUF88  24.76 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000245308  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  30.23 
 
 
242 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  24.77 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0180  hypothetical protein  28.1 
 
 
254 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  24.36 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  26.29 
 
 
284 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0057  hypothetical protein  27 
 
 
246 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.184388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4318  hypothetical protein  33.87 
 
 
298 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.577985  normal  0.180731 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>