194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3191 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  87.71 
 
 
480 aa  810    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  100 
 
 
478 aa  976    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  63.58 
 
 
440 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  81.88 
 
 
564 aa  482  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  80.28 
 
 
381 aa  476  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  79.06 
 
 
496 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  77.17 
 
 
483 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  69.73 
 
 
508 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  68.14 
 
 
498 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  58.73 
 
 
507 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  68.14 
 
 
498 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  77.17 
 
 
483 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  78.34 
 
 
498 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  59.52 
 
 
472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  78.62 
 
 
501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  78.65 
 
 
477 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  66.24 
 
 
421 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  63.14 
 
 
275 aa  359  8e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  53.31 
 
 
308 aa  312  7.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  58.67 
 
 
264 aa  304  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  41.76 
 
 
260 aa  213  4.9999999999999996e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  37.22 
 
 
253 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  36.98 
 
 
253 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  37.74 
 
 
253 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  34.48 
 
 
412 aa  167  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  37.59 
 
 
249 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  35.31 
 
 
378 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  48.32 
 
 
470 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  35.54 
 
 
787 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  35.54 
 
 
842 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  34.18 
 
 
789 aa  110  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  27.11 
 
 
272 aa  109  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  33.12 
 
 
600 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  28.57 
 
 
311 aa  103  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0898  hypothetical protein  28.57 
 
 
311 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0915  hypothetical protein  28.57 
 
 
311 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281794  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  32.93 
 
 
268 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18070  Protein of unknown function DUF88  27.48 
 
 
335 aa  99  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.304133  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1934  protein of unknown function DUF88  27.52 
 
 
552 aa  98.6  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000288494  normal  0.0274849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  29.76 
 
 
275 aa  96.7  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  27.55 
 
 
258 aa  96.7  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1014  hypothetical protein  29.41 
 
 
299 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4443  hypothetical protein  27.46 
 
 
329 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  31.13 
 
 
249 aa  93.6  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  30.92 
 
 
272 aa  91.3  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  25.78 
 
 
259 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  27.8 
 
 
487 aa  87.8  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  27.44 
 
 
258 aa  87.8  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  28.52 
 
 
319 aa  87.4  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0056  protein of unknown function DUF88  26.4 
 
 
448 aa  86.7  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0028  protein of unknown function DUF88  30.41 
 
 
509 aa  84.7  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  30.59 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  27.27 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  30.59 
 
 
232 aa  84  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  26.02 
 
 
408 aa  84  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  30.91 
 
 
371 aa  84  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  26.34 
 
 
419 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  30.56 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  25.48 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  25.48 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  30.04 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  28.46 
 
 
432 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1706  hypothetical protein  29.29 
 
 
507 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.936741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  30.84 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0344  protein of unknown function DUF88  30.57 
 
 
504 aa  80.5  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.752457  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  27.84 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  27.46 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  36.59 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  29.2 
 
 
251 aa  79.7  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  27.17 
 
 
246 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  27.84 
 
 
268 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  28.05 
 
 
335 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  28.7 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  26.36 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  31.13 
 
 
265 aa  77  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11160  conserved hypothetical protein  26.91 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997063  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  28 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  32.67 
 
 
432 aa  76.6  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  29.65 
 
 
247 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  34.92 
 
 
260 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0095  hypothetical protein  27.31 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0117028  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1289  protein of unknown function DUF88  33.08 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  hitchhiker  0.00441203 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3848  hypothetical protein  30.29 
 
 
461 aa  74.3  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  27.43 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000370224  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11150  hypothetical protein  32.68 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.280093 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  32.89 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0587  protein of unknown function DUF88  27.7 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000787089  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2484  hypothetical protein  30.67 
 
 
439 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00113577  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1187  hypothetical protein  26.17 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000236385  decreased coverage  0.000174597 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  27.36 
 
 
247 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  27.07 
 
 
276 aa  73.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2469  protein of unknown function DUF88  32.43 
 
 
629 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  30.53 
 
 
262 aa  72  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  32.79 
 
 
242 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  25.81 
 
 
252 aa  72  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  27.11 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  25.56 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  25.56 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  27.57 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  26.52 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>