124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3232 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  848    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  69.04 
 
 
432 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  67.22 
 
 
247 aa  342  5e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  67.08 
 
 
252 aa  341  1e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  67.08 
 
 
249 aa  340  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000370224  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  67.21 
 
 
247 aa  338  9e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0316  hypothetical protein  65.22 
 
 
264 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  64.61 
 
 
249 aa  330  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  65.02 
 
 
247 aa  326  6e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6293  protein of unknown function DUF88  58.33 
 
 
262 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  60.64 
 
 
260 aa  306  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  59.23 
 
 
234 aa  289  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  59.23 
 
 
234 aa  289  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  55.6 
 
 
272 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  54.2 
 
 
264 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11160  conserved hypothetical protein  56.18 
 
 
262 aa  280  5e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997063  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0520  hypothetical protein  53.33 
 
 
262 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  52.67 
 
 
272 aa  270  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  59.09 
 
 
240 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  52.5 
 
 
246 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  50.2 
 
 
259 aa  256  6e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0095  hypothetical protein  51.09 
 
 
273 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0117028  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  49.05 
 
 
275 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  47.22 
 
 
258 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  48.55 
 
 
258 aa  253  6e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  48.39 
 
 
253 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  48.8 
 
 
259 aa  243  6e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  51.28 
 
 
276 aa  242  7.999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4005  hypothetical protein  46.72 
 
 
263 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4482  hypothetical protein  49.79 
 
 
267 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  46.04 
 
 
260 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  47.57 
 
 
286 aa  232  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4745  hypothetical protein  48.54 
 
 
246 aa  230  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  43.23 
 
 
265 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  45.97 
 
 
242 aa  226  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  42.38 
 
 
268 aa  219  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  41.03 
 
 
268 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2026  hypothetical protein  47.04 
 
 
270 aa  213  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3025  protein of unknown function DUF88  42.59 
 
 
285 aa  212  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.775317  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  47.56 
 
 
335 aa  211  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3744  hypothetical protein  42.53 
 
 
287 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1386  hypothetical protein  40.07 
 
 
303 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1934  protein of unknown function DUF88  48.65 
 
 
552 aa  206  9e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000288494  normal  0.0274849 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  43.97 
 
 
262 aa  203  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  44.92 
 
 
249 aa  203  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0180  hypothetical protein  42.06 
 
 
254 aa  200  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  41.26 
 
 
284 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0169  hypothetical protein  44.54 
 
 
271 aa  199  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.654892  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  43.7 
 
 
239 aa  196  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  44.21 
 
 
248 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  44.21 
 
 
248 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0057  hypothetical protein  44.64 
 
 
246 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.184388 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11150  hypothetical protein  43.26 
 
 
314 aa  188  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.280093 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  56 
 
 
371 aa  179  9e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  41.49 
 
 
236 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05410  Protein of unknown function DUF88  39.5 
 
 
312 aa  172  6.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000245308  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4318  hypothetical protein  54.14 
 
 
298 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.577985  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2536  hypothetical protein  38.32 
 
 
313 aa  155  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13473  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1180  hypothetical protein  32.75 
 
 
259 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  30.52 
 
 
232 aa  124  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  30.52 
 
 
232 aa  123  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  30.52 
 
 
232 aa  123  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  30.83 
 
 
279 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  32.88 
 
 
251 aa  120  6e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  28.57 
 
 
229 aa  119  9e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  29.01 
 
 
440 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  28.75 
 
 
421 aa  91.3  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  29.41 
 
 
507 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  29.41 
 
 
508 aa  90.9  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  29.41 
 
 
501 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  27.59 
 
 
483 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  32.17 
 
 
334 aa  89  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  27.97 
 
 
472 aa  88.2  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  27.59 
 
 
483 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  28.91 
 
 
498 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  28.91 
 
 
498 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  26.1 
 
 
498 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0356  hypothetical protein  41.35 
 
 
160 aa  87.4  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198586 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  28.4 
 
 
496 aa  86.7  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  26.97 
 
 
564 aa  86.7  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  27.73 
 
 
477 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  29.51 
 
 
264 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  27.27 
 
 
480 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  28.29 
 
 
381 aa  84  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  27.68 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3462  hypothetical protein  34.59 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  26.24 
 
 
478 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  32.34 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  29.58 
 
 
249 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0857  protein of unknown function DUF88  37.4 
 
 
275 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  33.33 
 
 
319 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  28.45 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  28.03 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  28.27 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  25.86 
 
 
272 aa  68.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  25.32 
 
 
487 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  32.35 
 
 
378 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  26.95 
 
 
789 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  22.49 
 
 
311 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0855  protein of unknown function DUF88  32.88 
 
 
272 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>