80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3450 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3450  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  755    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0757309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0855  protein of unknown function DUF88  32.96 
 
 		 272 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0449  hypothetical protein  32.82 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.924551  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0857  protein of unknown function DUF88  38.89 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  41.54 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  37.21 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4967  hypothetical protein  36.84 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758138  normal  0.0411566 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  37.82 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  41.88 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  36.92 
 
 		 335 aa  62  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05410  Protein of unknown function DUF88  38.6 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000245308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  36.07 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6293  protein of unknown function DUF88  36.96 
 
 		 262 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  35.71 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  36.36 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000370224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  37.7 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1386  hypothetical protein  37.1 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  36 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  36 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  36.51 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0520  hypothetical protein  36.59 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  36.72 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0316  hypothetical protein  37.7 
 
 		 264 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0095  hypothetical protein  31.48 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0117028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4318  hypothetical protein  36.29 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.577985  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1934  protein of unknown function DUF88  37.29 
 
 		 552 aa  57.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000288494  normal  0.0274849 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  36.21 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2536  hypothetical protein  33.87 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13473  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  35.29 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  36.07 
 
 		 240 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  35.11 
 
 		 252 aa  57  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  36.07 
 
 		 247 aa  57  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3025  protein of unknown function DUF88  37.19 
 
 		 285 aa  57  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.775317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3744  hypothetical protein  38.02 
 
 		 287 aa  57  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0180  hypothetical protein  32 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  36 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11150  hypothetical protein  36.84 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.280093 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  30.6 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  37.19 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  37.07 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2026  hypothetical protein  33.13 
 
 		 270 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4745  hypothetical protein  35.2 
 
 		 246 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  35.16 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  36.36 
 
 		 247 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  36.36 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4005  hypothetical protein  35.9 
 
 		 263 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11160  conserved hypothetical protein  33.59 
 
 		 262 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  34.43 
 
 		 279 aa  53.1  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  33.05 
 
 		 265 aa  53.1  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  34.13 
 
 		 272 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  34.13 
 
 		 239 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  35.29 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  34.4 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  26.02 
 
 		 232 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3462  hypothetical protein  38.74 
 
 		 225 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4482  hypothetical protein  35.04 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  26.02 
 
 		 232 aa  50.8  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  26.02 
 
 		 232 aa  50.8  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  25.64 
 
 		 229 aa  50.4  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  30.58 
 
 		 268 aa  50.4  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  51.06 
 
 		 259 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  32.26 
 
 		 258 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  29.75 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  29.06 
 
 		 242 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  28.96 
 
 		 249 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1180  hypothetical protein  31.03 
 
 		 259 aa  47.4  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  31.46 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  35.79 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0169  hypothetical protein  29.87 
 
 		 271 aa  46.6  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.654892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  41.67 
 
 		 258 aa  46.6  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  30.86 
 
 		 470 aa  46.2  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  32 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  31.62 
 
 		 253 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  31.62 
 
 		 253 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  31.62 
 
 		 253 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  34.21 
 
 		 248 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  34.21 
 
 		 248 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  30.7 
 
 		 264 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  35.16 
 
 		 319 aa  42.7  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0057  hypothetical protein  34.21 
 
 		 246 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>