108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0190 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0181  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62015  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0190  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0170  GntR family transcriptional regulator  98.5 
 
 		 200 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.321689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0447  regulatory protein GntR, HTH  75.62 
 
 		 240 aa  278  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0220  regulatory protein GntR, HTH  75 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  63 
 
 		 243 aa  234  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0791  transcriptional regulator, GntR family  27.57 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  28.43 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0694  transcriptional regulator  27.52 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1903  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.7 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4198  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 260 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 256 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  27.86 
 
 		 244 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 258 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 268 aa  52.4  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 247 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 243 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2420  transcriptional regulator, GntR family  23.67 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.333552 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  22.27 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0013  GntR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 251 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000501062  n/a   
 
 
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  25.81 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4083  GntR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 250 aa  48.5  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 245 aa  48.5  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  26.11 
 
 		 261 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  26.11 
 
 		 261 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 248 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 245 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  23.67 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  28.09 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  22.8 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  22.8 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  25.98 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 267 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 249 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  22.8 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  22.8 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  22.8 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  22.8 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  25.5 
 
 		 246 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  22.44 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  25.25 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  22.8 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1484  transcriptional regulator, GntR family  23.3 
 
 		 244 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  23.9 
 
 		 239 aa  45.8  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  25.85 
 
 		 278 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0617  transcriptional regulator, GntR family  24.54 
 
 		 250 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  22.8 
 
 		 265 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  25.85 
 
 		 278 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 232 aa  45.4  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 247 aa  45.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 249 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3762  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 264 aa  44.7  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  25.24 
 
 		 269 aa  44.7  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7505  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  24.75 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1614  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.842348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  23.04 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  25.12 
 
 		 273 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 332 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 376 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 376 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  25.26 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1926  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 270 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3817  transcriptional regulator, GntR family  25.62 
 
 		 256 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0594434  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  26.24 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  23.76 
 
 		 270 aa  42.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  23.15 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1596  transcriptional regulator, GntR family  22.39 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0922621  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  21.08 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 267 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 255 aa  42.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 259 aa  42.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  23.15 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 241 aa  42.4  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  22.64 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  23.11 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>