85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0170 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0170  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.321689 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0190  GntR family transcriptional regulator  98.5 
 
 		 200 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0181  GntR family transcriptional regulator  98.5 
 
 		 200 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62015  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0447  regulatory protein GntR, HTH  75.12 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0220  regulatory protein GntR, HTH  74.5 
 
 		 240 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  64 
 
 		 243 aa  238  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 239 aa  148  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 269 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0791  transcriptional regulator, GntR family  27.57 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  27.94 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1903  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.7 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0694  transcriptional regulator  27.06 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4198  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 262 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 256 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 260 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 268 aa  52.8  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 255 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 260 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 270 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  26.34 
 
 		 242 aa  52  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2420  transcriptional regulator, GntR family  23.67 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.333552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 245 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  26.97 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  21.8 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  22.93 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  25.62 
 
 		 261 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  25.62 
 
 		 261 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  23.5 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 247 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1484  transcriptional regulator, GntR family  23.53 
 
 		 244 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  25.85 
 
 		 278 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  25.85 
 
 		 278 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 249 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  25.5 
 
 		 246 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7505  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 231 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  23.19 
 
 		 256 aa  45.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 259 aa  45.1  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  25.25 
 
 		 247 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  25.24 
 
 		 269 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4083  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 250 aa  45.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3762  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 264 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  24.53 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  25.73 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1614  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 250 aa  43.5  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.842348  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0013  GntR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000501062  n/a   
 
 
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  24.74 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  25.12 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  25.49 
 
 		 274 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  23.66 
 
 		 239 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 267 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  23.76 
 
 		 270 aa  42.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  23.66 
 
 		 239 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  23.66 
 
 		 239 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  23.66 
 
 		 239 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 267 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  22.64 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 246 aa  42.4  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  23.15 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  23.15 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0617  transcriptional regulator, GntR family  24.07 
 
 		 250 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  24.26 
 
 		 238 aa  42  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  23.66 
 
 		 239 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1926  GntR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 270 aa  41.6  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 264 aa  41.2  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  26.11 
 
 		 254 aa  41.2  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>