More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1926 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1926  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 270 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5996  GntR family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 274 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3762  GntR family transcriptional regulator  54.25 
 
 		 264 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0694  transcriptional regulator  53.17 
 
 		 266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0791  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1903  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  39.13 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  38.55 
 
 		 273 aa  149  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  38.43 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  38.43 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2768  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  41.52 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  41.52 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4198  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 249 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 248 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  36.09 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  37.72 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 249 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 243 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 248 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  35.25 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 232 aa  102  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 252 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 252 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 249 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 240 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  31.11 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  28.63 
 
 		 232 aa  98.6  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 		 238 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 286 aa  96.3  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  35.34 
 
 		 255 aa  96.7  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.95 
 
 		 255 aa  96.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 		 245 aa  95.9  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 		 244 aa  95.5  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 256 aa  95.5  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.44 
 
 		 239 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  36.15 
 
 		 239 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 		 246 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 243 aa  93.2  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 239 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 248 aa  92.8  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 238 aa  92  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 238 aa  92  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.25 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 235 aa  91.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.25 
 
 		 243 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 		 246 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1446  transcriptional regulator, GntR family  34.4 
 
 		 290 aa  89.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2024  transcriptional regulator, GntR family  34.4 
 
 		 290 aa  89.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.205752  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 232 aa  89.4  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.94 
 
 		 242 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2758  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.14 
 
 		 240 aa  89  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  34.98 
 
 		 259 aa  89  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  32.05 
 
 		 250 aa  89.4  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 		 241 aa  89  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 		 242 aa  89  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 250 aa  89  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>