57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3535 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3535  NLP/P60 protein  100 
 
 		 153 aa  316  7.999999999999999e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0987599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2672  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.95108 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1584  NLP/P60 protein  40.15 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0296  NLP/P60 protein  41.32 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2686  hypothetical protein  29.2 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  31.78 
 
 		 226 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  25.4 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  32.22 
 
 		 297 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  33.62 
 
 		 319 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  24.19 
 
 		 250 aa  45.1  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  23.58 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  30.33 
 
 		 480 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  25.89 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  28.97 
 
 		 207 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  34.07 
 
 		 400 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1884  NLP/P60 protein  25 
 
 		 174 aa  43.9  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.715704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  25 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  34.02 
 
 		 326 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 366 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  29.91 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  26.36 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  29.29 
 
 		 432 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  30.11 
 
 		 298 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  32 
 
 		 373 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  33.96 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  30.17 
 
 		 367 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  29.29 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  24.04 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  26.96 
 
 		 368 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  28.87 
 
 		 188 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  30.08 
 
 		 495 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  33.66 
 
 		 198 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  31.25 
 
 		 349 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  34.19 
 
 		 177 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0599  NLP/P60 family protein  37.82 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4708  NLP/P60 protein  23.44 
 
 		 214 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341111  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  29.06 
 
 		 366 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  30.77 
 
 		 205 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  25.21 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  32.08 
 
 		 258 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  30.77 
 
 		 392 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  29.91 
 
 		 354 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  29.1 
 
 		 337 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  52.94 
 
 		 374 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  28.69 
 
 		 337 aa  41.2  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  31.48 
 
 		 248 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  26.24 
 
 		 265 aa  41.2  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  31.13 
 
 		 249 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3720  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  30 
 
 		 306 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  25.66 
 
 		 207 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  26.79 
 
 		 208 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  28.97 
 
 		 353 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  31.93 
 
 		 327 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1892  hypothetical protein  36.84 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0738219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  34.69 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0600  NLP/P60 family protein  36.97 
 
 		 144 aa  40.4  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0781347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>