56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3720 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3720  NLP/P60 protein  100 
 
 		 139 aa  280  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2985  tail assembly protein  36.36 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  32 
 
 		 221 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  29.03 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  28.23 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  27.91 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  26.61 
 
 		 211 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  27.48 
 
 		 287 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  26.05 
 
 		 223 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  27.48 
 
 		 279 aa  48.9  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  27.41 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  26.05 
 
 		 224 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  26.05 
 
 		 223 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  26.05 
 
 		 223 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  26.05 
 
 		 223 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  26.05 
 
 		 223 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  26.05 
 
 		 223 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  26.05 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  25.58 
 
 		 220 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0020  NLP/P60 protein  31.25 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  29.03 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  25.86 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  25.86 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  27.68 
 
 		 177 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  27.68 
 
 		 198 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  27.42 
 
 		 202 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  25 
 
 		 234 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  25 
 
 		 218 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  25 
 
 		 218 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  25 
 
 		 218 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  25 
 
 		 234 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  25 
 
 		 218 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  25 
 
 		 234 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  25 
 
 		 234 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  25.86 
 
 		 335 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  27.27 
 
 		 391 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  26.98 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  26.98 
 
 		 214 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  28.46 
 
 		 214 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  31.82 
 
 		 226 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  32.69 
 
 		 327 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  26.98 
 
 		 214 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  33.07 
 
 		 335 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  27.78 
 
 		 234 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  29.27 
 
 		 242 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3535  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 153 aa  40.8  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0987599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  24.07 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  28.95 
 
 		 242 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16250  NLP/P60 protein  26.67 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  29.91 
 
 		 225 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  27.56 
 
 		 246 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  28.46 
 
 		 242 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  24.41 
 
 		 265 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  28.57 
 
 		 259 aa  40.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  26.87 
 
 		 222 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  26.27 
 
 		 189 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>